ウィルス感染症の治療のための組成物及び方法

专利摘要:
本発明は、安定化αらせん構造（本明細書でＳＡＨとも称する）のウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメインを有するポリペプチドを用いる組成物、キット及び方法を提供する。この組成物は、ウィルス感染の治療及び／又は予防に有用である。本発明は、少なくともその一部が、優れたタンパク分解、酸、及び熱安定性を示し、ペプチドの本来のαらせん構造を回復する、ウィルス性炭化水素で架橋したαらせんペプチドが、ウィルス融合過程の妨害において非常に有効であり、そして対応する非改変ペプチドと比較して優れた薬理動態特性を保持することを明らかにしている、本明細書で提供されている結果に基づいている。
公开号:JP2011510076A
申请号:JP2010544340
申请日:2009-01-23
公开日:2011-03-31
发明作者:エイチ；バード グレゴリー；ディー；ワレンスキー ローレン
申请人:ダナ ファーバー キャンサー インスティテュート インコーポレイテッド；
IPC主号:C07K14-155

专利说明:

[0001] （関連出願の相互参照）
本願は、その全てを参照して本明細書に組み込まれている、２００８年１月２３日に出願された、米国特許仮出願第６１／０６２，００７号の優先権を主張する。]
背景技術

[0002] ウィルスコートタンパク質が宿主細胞の表面受容体を認識して結合する、ウィルス融合の分子プロセスは、ウィルス感染症の予防及び治療における重要な標的である。宿主細胞受容体によってウィルスグリコプロテインが認識されると、ウィルス融合タンパク質はウィルスの融合及び感染に必須である構造変化を受ける。Ｎ末端及びＣ末端に位置する、一連の疎水性アミノ酸が体系化して宿主細胞膜を貫通する複合体を形成する。両親媒性の７アミノ酸繰り返しドメイン（heptad repeat domain）を２つ含有している隣接するウィルスグリコプロテインが互いに畳み込まれて、６個のαへリックスバンドルから成る、ヘアピンの三量体を形成する。この６へリックスバンドルモチーフは、フィロウィルス（Filovirus、エボラ）（Malashkevich, V.N. et al., PNAS, 1999. 96(6): p. 2662-2667; Weissenhorn, W., et al., Molecular Cell, 1998. 2(5): p. 605-616）、オルトミクソウィルス（Orthomyxovirus、インフルエンザ）（Wilson, I.A., J.J. Skehel, and D.C. Wiley, Nature, 1981. 289(5796): p. 366-37; Bullough, P.A., et al., Nature, 1994. 371(6492): p. 37-43）、コロナウィルス（Coronavirus、ＳＡＲＳ）（Xu, Y.H., et al. Journal of Biological Chemistry, 2004. 279(47): p. 49414-49419）、パラミクソウィルス（Paramyxovirus、ＨＲＳＶ）（Zhao, X., et al., PNAS, 2000. 97(26): p. 14172-14177）及びレトロウィルス（Retrovirus、ＨＩＶ）（Chan, D.C., et al., Cell, 1997. 89(2): p. 263-27; Weissenhorn, W., et al., Nature, 1997. 387(6631): p. 426-430）を含む、多くのウィルスファミリーの間で広く保存されている。]
[0003] ＨＩＶエンベロープタンパク質ｇｐ１２０及びｇｐ４１は互いに非共有的に結合して二量体の三量体を形成する。宿主細胞上で、ｇｐ１２０は、宿主細胞認識に関連しているグリコプロテインである、ＣＤ４、ＣＸＣＲ４、及びＣＣＲ５と特異的に相互作用する。ウィルス膜貫通グリコプロテインである、ｇｐ４１は宿主細胞によるウィルス粒子の摂取をもたらす、ウィルスと細胞膜の融合に関与している。ｇｐ１２０がＣＤ４に結合すると、ｇｐ４１は、その生来の状態から融合性６へリックスバンドルに変換する、構造変化を受ける。この変化に関与するｇｐ４１の領域は、膜貫通ドメイン付近の、Ｃ末端７アミノ酸繰り返し（ＣＨＲ又はＨＲ−２）の４３残基（Ｃ４３）、及び融合ペプチドドメインの直近位に見出された、Ｎ末端７アミノ酸繰り返し（ＮＨＲ又はＨＲ−１）の５１残基（Ｎ５１）である。ペプチドＮ５１及びＣ４３は、熱及びタンパク分解に安定である、高次の三量体複合体の形成に関与する、らせん逆平行ヘテロ二量体の形成に順応している。]
[0004] このウィルス融合プロセスを阻害するペプチドをウィルス感染の予防及び治療に用いることができる。例えば、ＨＩＶのｇｐ４１Ｎ末端７アミノ酸繰り返しドメイン（ＨＲ−１）の５５３〜５９０残基及びＣ末端７アミノ酸繰り返しドメイン（ＨＲ−２）の６３０〜６５９及び６４８〜６７３残基に対応するペプチドが、各種ＨＩＶ株の複製を阻害するということが証明されている。これらのペプチドが、ＨＩＶエンベロープグリコプロテインとの相互作用による細胞−細胞融合を阻害することが研究によって究明された。]
[0005] Ｔ２０又はエンフュービルタイド（enfuvirtide）は、ＨＩＶの治療のために、ｇｐ４１のＣＨＲ領域に基づいて開発された最初の融合阻害ペプチドである。エンフュービルタイドは、通常の実験室用の株及びＨＩＶ−１及びＨＩＶ−２の最初の分離株を含む、ＨＩＶの多くの株及びサブタイプに対してナノモル濃度で活性である（Wild, C.T., et al., PNAS, 1994. 91(21): p. 9770-9774）。]
[0006] しかしながら、エンフュービルタイドは、コスト、経口によるバイオアベイラビリティーが無いこと（皮下注射はアクセス容易性及びコンプライアンスを制限する）及び貧弱なインビボ安定性（Kilby, J.M., et al., Nuclic AidsResearch and Human Retroviruses, 2002. 18(10): p. 685-693）及び生物活性二次構造の欠落を含む、多くの因子によって第三治療選択肢であり続けている。
従って、ウィルス融合プロセスのペプチドによる阻害は機構的に適していて、臨床的に有効であるが、両親媒性融合ペプチドの生物物理学的及び生物化学的特性には、それらの使用を妨げる多くの課題が存在する。]
発明が解決しようとする課題

[0007] 本発明は安定なαらせん構造（本明細書でＳＡＨとも称する）を有するポリペプチドを用いる組成物、キット及び方法を対象にしている。組成物はウィルス感染症の治療及び／又は予防に有用である。本発明は、少なくともその一部は、ウィルスの炭化水素で架橋されたαらせんペプチドが、タンパク分解、酸、及び熱に対する優れた安定性を示し、ペプチド本来のαらせん構造を回復して、ウィルス融合プロセスの阻害に非常に有効であり、そして対応する改変していないペプチドと比較して優れた薬物動態特性を有していることを明らかにしている、本明細書で提供されている結果に基づいている。]
[0008] 第一の態様では、本発明は安定なウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメインを有する改変ポリペプチドを対象にしている。αらせん７アミノ酸繰り返しドメインが少なくとも１つの炭化水素架橋で安定化されることが好ましいが、２つ、３つ又はそれ以上の炭化水素架橋を含むことができる。適切な炭化水素架橋（例えば、鎖）は本明細書に記載されている。適切なウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメインは、細胞接着及び／又は細胞融合に直接的又は間接的に関与しているαらせんドメイン又はそれらの類縁体を有する何れかのウィルスから得られる。適切な安定化αらせん７アミノ酸繰り返しドメインは、呼吸器合胞体ウイルス、パラインフルエンザウィルス、インフルエンザウィルス、コロナウィルス、エボラウィルス及びＨＩＶを包含する、多数のウィルスから得ることができる。本発明の改変ポリペプチドは安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２、若しくはそれらの部分）を含有することができる。]
[0009] 本発明の改変ポリペプチドの何れも組成物及びキットに含有させることができる。]
[0010] 別の態様では、本発明はＨＩＶの細胞への伝播を阻害する方法を対象としている。この方法では、ＨＩＶウィルスが細胞を感染することを阻害するために、ＨＩＶウィルスを改変ポリペプチドの有効用量に接触させる。好ましくは、改変ポリペプチドが、炭化水素架橋で安定化されているＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２、或いはそれらの部分）を有している。]
[0011] 本発明は、ＨＩＶに感染している個体におけるＡＩＤＳを治療するか又は発症を遅らせる方法も含んでいる。安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２、或いはそれらの部分）を含んでいる改変ポリペプチドを有している医薬組成物をＨＩＶに感染している個体に投与し、それによってＡＩＤＳを治療するか又は発症を遅らせる。ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインを炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0012] 更に別の態様では、本発明はＨＩＶに感染している個体におけるＣＤ４＋細胞の数を増大する方法を対象としている。この方法は、ＨＩＶに感染している個体に安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２、或いはそれらの部分）を含んでいる改変ポリペプチドを有している医薬組成物の有効用量を投与することを含んでいる。組成物の投与が、個体におけるＣＤ４＋細胞数の増大をもたらす。ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインを炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0013] 更に別の態様では、本発明は、ＨＩＶ感染細胞と非感染細胞の間での合胞体形成を阻害する方法を対象としている。この方法は、感染細胞を安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２、或いはそれらの部分）を含んでいる改変ポリペプチドの有効用量と接触させ、それによって細胞間の合胞体形成を阻害することを含んでいる。ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインを炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0014] 更に別の態様では、本発明はＨＩＶを不活性化する方法を対象としている。この方法はウィルスを安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２、或いはそれらの部分）を含んでいる改変ポリペプチドの有効用量と接触させて、ＨＩＶを不活性状態にすること（例えば、非感染）を含んでいる。ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインを炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0015] 更に別の態様では、本発明は個体におけるＨＩＶ感染を予防する方法を対象としている。この方法は、個体に安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２、或いはそれらの部分）を含んでいる改変ポリペプチドを有している医薬組成物の有効用量を投与することを含んでいる。ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインの投与は、ＨＩＶの個体に感染する能力を阻害する。ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインを炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0016] 改変ポリペプチドはＲＳＶ（ラウス肉腫ウィルス）の細胞への伝播を阻害するために使用することができる。ウィルスを安定化ＲＳＶウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を有する改変ポリペプチドの有効用量と接触させ、それによってウィルスが細胞に伝播することを阻害する。７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0017] 改変ポリペプチドはパラインフルエンザウィルスの細胞への伝播を阻害するためにも使用することができる。ウィルスを安定化パラインフルエンザウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を有する改変ポリペプチドの有効用量と接触させ、それによってウィルスが細胞に伝播することを阻害する。７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0018] 別の態様では、改変ポリペプチドはインフルエンザウィルスの細胞への伝播を阻害するためにも使用することができる。ウィルスを安定化インフルエンザウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を有する改変ポリペプチドの有効用量と接触させ、それによってウィルスが細胞に伝播することを阻害する。７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0019] 更に別の態様では、本発明はコロナウィルスの細胞への伝播を阻害する方法を対象としている。この方法はコロナウィルスを安定化コロナウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を有する改変ポリペプチドの有効用量と接触させ、それによってウィルスが細胞に伝播することを阻害することを含んでいる。７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0020] 更に別の態様では、本発明はエボラウィルスの細胞への伝播を阻害する方法を対象としている。この方法はエボラウィルスを安定化エボラウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を有する改変ポリペプチドの有効用量と接触させ、それによってウィルスが細胞に伝播することを阻害することを含んでいる。７アミノ酸繰り返しドメイン類縁体を炭化水素架橋で安定化することが好ましい。]
[0021] 本発明の態様では、本発明は本発明の改変ポリペプチドを医薬組成物として提供する。ある態様では、医薬組成物は腸内投与、好ましくは経口投与用である。]
[0022] 更に別の態様では、αらせん７アミノ酸繰り返しドメイン及びそれらの類縁体は、ポリペプチドを対象に投与することによって、ポリペプチドに応答する抗体を生成するために用いられる。更に、ポリペプチドの投与によって直接的又は間接的に生成された抗体（例えば、ヒト化抗体）が、次いでウィルス（例えば、ＨＩＶ、ＲＳＶ、パラインフルエンザ、インフルエンザ、コロナウィルス、エボラウィルス）感染の予防又は治療に用いられる。]
図面の簡単な説明

[0023] 図１は、ｇｐ４１グリコプロテインのドメインを示す。
図２Ａ及びＢは、Ａ）ｇｐ１６０のＨＸ株、及びＢ）ｇｐ１６０のＹＵ２株についてのアミノ酸配列を示す。ＨＲ−１ドメインを太字及び下線付きで、そしてＨＲ−２ドメインを太字及びイタリック体で示してある。
図３はＨＩＶｇｐ４１ ＨＲ−１及びＨＲ−２ドメイン、及び別のウィルスの相同領域についてのアミノ酸配列を示す。
図４Ａは、ＨＩＶの６へリックスバンドル及びらせんＮ３６及びＣ３４の主要ならせん間相互作用を示す。Ｎ３６らせんの１つ及び２つのＣ３４らせんを明確にするために薄くしてある。らせんの輪が更に、ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇの命名に基づいて、らせん間の主要な接点を示している。
図４Ｂは、ＲＳＶ、インフルエンザ、ＳＡＲＳ及びエボラ由来のＨＲ−類縁ドメインによって形成された融合バンドルを示す。６らせん融合バンドルが多くの種に渡ってよく保存されている。
図５Ａは、順次Ｎ末端を欠失させたＨＩＶ−１ ＨＲ−２ドメインポリペプチド内から由来するアミノ酸配列鋳型を例示している。
図５Ｂは、順次Ｃ末端を欠失させたＨＩＶ−１ ＨＲ−２ドメインポリペプチド内から由来するアミノ酸配列鋳型を例示している。
図６は、互い違いにＮ末端及びＣ末端を欠失させたＨＩＶ−１ ＨＲ２ドメイン内から由来する配列鋳型を例示する。
図７は、切断されたＳＡＨ−ｇｐ４１化合物である、ＳＡＨ−ｇｐ４１（６２６−６４５）（Ａ）の合成デザインを示す。Ｘ＝Ｓ５アミノ酸、Ｂ＝ノルロイシン。
図８は、キメラの産生を表現している、ＳＩＶのＨＲ２ドメイン及びＨＩＶ‐１のＨＸ及びＹＵ２株内から由来する配列鋳型を例示する。
図９は、ＨＩＶ ｇｐ４１（６２６−６６３）に適用した７アミノ酸繰り返しドメインモチーフ及び関連する好ましいアミノ酸残基を説明している。ＨＲ１相互作用を保存するのに必要な特定アミノ酸残基を表現している、ＨＩＶ‐１ ＨＲ２ドメイン内由来の配列鋳型を例示している。従って、ダッシュ記号で表示されている位置は活性を途絶することなく置換／変異可能である。
図１０Ａ〜Ｄは、Ａ）２個のＳ５アミノ酸を用いるらせん１回転に渡るｉ、及びｉ＋４；Ｂ）１個のＳ８及び１個のＲ５アミノ酸、又は１個のＲ８及び１個のＳ５アミノ酸を用いるらせん２回転に渡るｉ、及びｉ＋７；Ｃ）２個のｉ、ｉ＋４、又は２個のｉ、ｉ＋７、又は１個のｉ、ｉ＋４と１個のｉ、ｉ＋７の架橋を用いる二重架橋；及びＤ）ｉ、ｉ＋４、ｉ、ｉ＋７、又は別の架橋（例えば、ｉ、ｉ＋３）の何れかの組み合わせを用いる三重架橋；の位置に形成されるらせん安定化架橋の可能な組み合わせを示している。
図１１は、単一架橋ＳＡＨ−ｇｐ４１ペプチド（例えば、Ｎ末端：Ａｃ、ＦＩＴＣ−βＡｌａ、ビオチン−βＡｌａ；Ｃ末端：ＣＯＮＨ２、ＣＯＯＨ）を示している。 Ｘ＝Ｓ５アミノ酸、Ｂ＝ノルロイシン
図１２は、二重及び三重架橋ＳＡＨｇｐ４１ペプチド（例えば、Ｎ末端：Ａｃ、ＦＩＴＣ−βＡｌａ、ビオチン−βＡｌａ；Ｃ末端：ＣＯＮＨ２、ＣＯＯＨ）の配列である。 Ｘ＝Ｓ５アミノ酸、Ｂ＝ノルロイシン
図１３は、非架橋、二重架橋及び三重架橋ｇｐ４１ＨＲ−２ペプチドを説明していて、らせん中の架橋を位置決めする戦略を示している。架橋は、らせん間の相互作用面を保持及び／又は最適化するように位置付けられている。Ｘ＝Ｓ５アミノ酸、Ｂ＝ノルロイシン
図１４Ａ〜Ｆは、単一及び二重架橋ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物が、改変していないｇｐ４１ペプチドとｐＨ７及びｐＨ２で比較して、より高いらせん安定性を示すことを説明している。 それぞれの化合物に対するらせん率（パーセント）を括弧内に示してある。 Ａ）ｐＨ７おける、ＳＡＨ−ｇｐ４１（６２６−６６２）単一及び二重架橋ペプチド、 Ｂ）ｐＨ７おける、ＳＡＨ−ｇｐ４１（６３８−６７３）単一架橋ペプチド、 Ｃ）ｐＨ７おける、ＳＡＨ−ｇｐ４１（６３８−６７３）二重架橋ペプチド、 Ｄ）ｐＨ２おける、ＳＡＨ−ｇｐ４１（６２６−６６２）単一及び二重架橋ペプチド、 Ｅ）ｐＨ２おける、ＳＡＨ−ｇｐ４１（６３８−６７３）単一及び二重架橋ペプチド、 Ｆ）ｐＨ２及び７において計算したＳＡＨ−ｇｐ４１化合物のらせん率を比較している 表。
図１５Ａ〜Ｃは、単一及び二重架橋ＳＡＨ−ｇｐ−４１化合物が改変していないｇｐ４１ペプチドとｐＨ７で比較すると、より高い熱安定性を示すことを説明している。 Ａ）選択した単一及び二重架橋ＳＡＨ−ｇｐ４１（６２６−６６２）化合物； Ｂ）単一架橋ＳＡＨ−ｇｐ４１（６３８−６７３）化合物； Ｃ）二重架橋ＳＡＨ−ｇｐ４１（６３８−６７３）化合物。
図１６Ａ〜Ｆは、ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物が、改変されていないｇｐ４１化合物と比較して、ｐＨ７においてキモトリプシンに対してそしてｐＨ２においてペプシンに対してより高いプロテアーゼ耐性を示すことを説明している。 Ａ）ＳＡＨ−ｇｐ４１（６２６−６６２）、キモトリプシン、ｐＨ７、 Ｂ）ＳＡＨ−ｇｐ４１（６３８−６７３）、キモトリプシン、ｐＨ７、 Ｃ）キモトリプシンの存在下におけるＳＡＨ−ｇｐ４１化合物の半減期の表、ｐＨ７、 Ｄ）ＳＡＨ−ｇｐ４１（６２６−６６２）、ペプシン、ｐＨ２、 Ｅ）ＳＡＨ−ｇｐ４１（６３８−６７３）、ペプシン、ｐＨ２、 Ｆ）ペプシンの存在下におけるＳＡＨ−ｇｐ４１化合物の半減期の表、ｐＨ２。
図１７は、ｇｐ４１−５へリックスバンドルへのＨＩＶ融合阻害ペプチドの蛍光偏光結合アッセイを示し、改変されていないペプチドと比較して、ＳＡＨ−ｇｐ４１の５へリックスバンドルへの増大した結合を示している。
図１８は、切断型ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物（Ａ）による合胞体形成の、エンフュービルタイド（Ｔ２０：ｇｐ４１（６３８−６７３））と比較して、向上した阻害を示す。より短い、架橋されたペプチドによる抗ウィルス活性を保持、更には増強する能力を強調表示している。
図１９は、選択したＳＡＨ−ｇｐ４１化合物のＨＩＶ菌株ＨＸＢｃ２、ＡＤＡ、及びＨＸＢｃ２Ｐ ３．２、及びＹＵ２に対する抗ウィルス活性を明らかにしている。ＡＭＬＶはネガティブコントロールとして供されている。
図２０Ａ-Ｂは、Ａ）ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物が、非改変ｇｐ４１からなる融合ペプチドの結合を阻害するＨＩＶ−１ＨＲ１耐性突然変異に打ち勝つことを明らかにしている。表にした値は、示されているＦＩＴＣ−ＨＲ１ペプチドに対するＨＲ２ペプチド入力限界の一部を示している。 Ｂ）は、選択したＳＡＨ−ｇｐ４１化合物が、耐性ＨＩＶ−１株、ＹＵ２の感染性の阻害において、対応する非改変ペプチドよりも著しく優れていることを示している。
図２１は、二重架橋ｇｐ４１ペプチドが、対応する非改変ペプチドと比較して、インビボにおいて著しく増強された薬理学的特性（安定性及びバイオアベイラビリティー）を有していることを示している。] 図１ 図１１ 図１２ 図１３ 図１４Ａ 図１４Ｂ 図１４Ｃ 図１４Ｄ 図１４Ｅ 図１４Ｆ
[0024] 本発明は安定化αらせん構造を有するポリペプチドを用いる組成物、キット及び方法を対象としている。組成物はウィルス感染を治療及び／又は予防するために有用である。本発明は、少なくともその一部が、ウィルス性の炭化水素で架橋されたαらせんペプチドが、それらの改変されていない対応物と比較すると、優れた構造、タンパク分解、酸及び熱安定性を有し、ウィルス／細胞融合の妨害において非常に効果があり、そしてインビボにおける優れた薬理学的特性を有していることを明らかにしている本明細書で提供されている結果に基づいている。]
[0025] αらせん７アミノ酸繰り返しドメインは、少なくとも１つの炭化水素架橋（しかし２、３、又はそれ以上の炭化水素架橋を含むことができる）によって安定化される。複数の炭化水素架橋を含むことが、長さが２０又はそれ以上のアミノ酸であるαらせんペプチドに特に適している。２つ以上の炭化水素架橋を包含することは実際、本明細書で示すように、改変ポリペプチドに非常に優れた構造、酸及び熱安定性をもたらし、際立って増強されたインビボ薬理学的特性を有する生物活性ペプチドを生じる。]
[0026] 定義
本明細書で用いられる用語「炭化水素架橋」は、少なくとも２つの改変アミノ酸を有しているポリペプチドを安定に架橋する過程を示し、それはそのポリペプチドの元来の二次構造を配座的にもたらすのに役立つ。炭化水素架橋は、αらせん二次構造を有する性質があるポリペプチドが、元来のαらせん構造を保持できるようにする。この二次構造はこのポリペプチドのタンパク分解による開裂及び熱に対する抵抗性を増大し、そして疎水性を増大することもできる。
従って、本明細書に記載されている炭化水素架橋されたポリペプチドは、対応する非架橋ポリペプチドと比較して改善された生物活性を有している。例えば、架橋ポリペプチドは、ＨＩＶポリペプチドのαらせんドメイン（例えば、ＨＲ−１／ＨＲ−２ドメイン）を包含することができ、これはＨＩＶの付着、融合、及び細胞の感染を妨げることができる。ある場合には、架橋ポリペプチドをウィルスの細胞への侵入を阻害するために用いることができる。
本明細書に記載されている架橋ポリペプチドを治療、例えばＨＩＶ感染及び／又はＡＩＤＳの治療に用いることができる。]
[0027] 炭化水素架橋ポリペプチドは２個の非天然アミノ酸の間に１個又はそれ以上の鎖（連鎖）を包含していて、この鎖はポリペプチドのαらせん二次構造を有意に増強する。一般に、この鎖は１つ又は２つのらせん回転の長さ（すなわち、約３．４又は約７アミノ酸）にわたっている。
従って、ｉ及びｉ＋３；ｉ及びｉ＋４；又はｉ及びｉ＋７に位置するアミノ酸が、化学修飾及び架橋のための理想的な候補である。従って、例えば、ペプチドが配列．．．Ｘ１、Ｘ２、Ｘ３、Ｘ４、Ｘ５、Ｘ６、Ｘ７、Ｘ８、Ｘ９．．．を有している場合には、Ｘ１とＸ４の間、又はＸ１とＸ５の間、又はＸ１とＸ８の間の架橋は、Ｘ２とＸ５の間、Ｘ２とＸ６間、又はＸ２とＸ９の間等の架橋のように有用である。
複数の架橋（例えば、２個、３個、４個又はそれ以上）の使用も意図されている。複数の架橋の使用はペプチドの安定化及び最適化、特にあるｇｐ４１融合ペプチドの場合として、ペプチドの長さを増大するために非常に効果がある。
従って本発明は、更に配列を安定化するため、又はより長いポリペプチドストレッチの構造安定化、タンパク分解抵抗性、酸安定性、熱安定性及び生物活性の増強を促進するためのいずれかにポリペプチド配列内への１つ以上の架橋の組み込みを包含する。]
[0028] ポリペプチドに関連して本明細書で用いられる用語「安定な」又は「安定化」は、炭化水素架橋されて、本来のαらせん構造を保持し、そして／又はタンパク分解抵抗性を改善し、そして／又は酸安定性を改善し、そして／又は熱安定性を改善しているポリペプチドを示す。]
[0029] 本明細書で用いられる「ＨＩＶ」は、ＨＩＶ−１及びＨＩＶ−２及びＳＩＶを包含するように意図されている。
「ＨＩＶ−１」は、ヒト免疫不全ウィルス１型を意味する。ＨＩＶ−１は、これに限定されないが、細胞外ウィルス粒子及びＨＩＶ−１感染細胞に関連するＨＩＶ−１の形態を包含する。
「ＨＩＶ−２」は、ヒト免疫不全ウィルス２型を意味する。ＨＩＶ−２は、これに限定されないが、細胞外ウィルス粒子及びＨＩＶ−２感染細胞に関連するＨＩＶ−２の形態を包含する。
用語「ＳＩＶ」は、サル、チンパンジー、及びその他の非ヒト霊長類に感染するＨＩＶに類似したウィルスである、さる免疫不全ウィルスを示す。
ＳＩＶは、これに限定されないが、細胞外ウィルス粒子及びＳＩＶ感染細胞に関連するＳＩＶの形態を包含する。]
[0030] 本明細書で用いられる「７アミノ酸繰り返しドメイン」及び「ＨＲドメイン」は、正確に折り畳むとαらせんを形成するポリペプチドを示す。用語「７アミノ酸繰り返しドメイン」及び「ＨＲドメイン」は、「ＨＲ様」及び「ＨＲ類縁」ポリペプチドを包含する。細胞接着及び融合に関連している多くのウィルスタンパク質は、ＨＩＶ、パラインフルエンザ、コロナウィルス及びその他を含む、ＨＲ、ＨＲ様、及びＨＲ類縁ドメインを含有している。
一般に、ＨＲドメインがＨＩＶのｇｐ４１から得られるのに対して、ＨＲ類縁ドメインは非ＨＩＶウィルスのエンベロープグリコプロテインから得られる。
多くのＨＲ及びＨＲ類縁ドメインポリペプチドは当該技術分野で公知であって、本明細書に記載されている。
一態様では、ＨＲドメインは、図５、図６又は配列番号１〜１４と４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、又はそれ以上同一のアミノ酸配列を有している。
ＨＲ及びＨＲ様ドメインは低い相同性を有しているが、非相互作用面よりも相互作用面により多く保存されている、共通のαらせん構造を共有することに留意すべきである（図４及び９を参照されたい）。]
[0031] 一態様では、ＨＲ改変ポリペプチドは、式：ａｂｃｄｅｆｇ（式中のａ及びｄは疎水性アミノ酸残基であり、ｂ、ｃ、ｅ、ｆ及びｇは何れかのアミノ酸である）：を有する７アミノ酸繰り返しドメインを包含している。式が２回又はそれ以上平行に反復することが好ましい。]
[0032] 例えば、更なる態様では、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは式：Ｗ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｗ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｙ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｌ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｓ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｑ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｎ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｅ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｌ（ａ）、又はそれらの同類アミノ酸置換（式中の、ｂ、ｃ、ｅ、ｆ及びｇは何れのアミノ酸であってもよい）：を有している。]
[0033] 更なる態様では、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは式：Ｔ（ｇ）、Ｗ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｗ（ｄ）、Ｄ（ｅ）、Ｒ（ｆ）、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｙ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｌ（ｄ）、Ｉ（ｅ）、ｆ、ｇ、ａ、Ｑ（ｂ）、ｃ、ｄ、Ｑ（ｅ）、Ｅ（ｆ）、Ｋ（ｇ）、ａ、Ｅ（ｂ）、ｃ、ｄ、Ｌ（ｅ）、ｆ、Ｅ（ｇ）、Ｌ（ａ）、又はそれらの同類アミノ酸置換（式中の指摘されていないアミノ酸は何れのアミノ酸であってもよい）：を有している。]
[0034] ＨＲ領域は、複数の７アミノ酸残基ストレッチ又は「ヘプタド」（各ヘプタドの７個のアミノ酸は「ａ」〜「ｇ」と命名される）を包含していることが知られている。式中の「ａ」位置及び「ｄ」位置のアミノ酸は通常疎水性である。
通常、ＨＲ領域は、イソロイシン又はロイシンで開始して終結する、８個のアミノ酸配列を含む、１個又はそれ以上のロイシンジッパー様モチーフ（ロイシンジッパー様反復とも示される）を包含している。
ヘプタド及びロイシンジッパー様モチーフは、ｇｐ４１のコイルドコイル構造、及びＨＲ領域由来ペプチドのコイルドコイル構造の形成に寄与している。一般にコイルドコイルは、第１位（「ａ」）及び第４位（「ｄ」）の疎水性残基、通常５位（「ｅ」）及び７位（「ｇ」）の荷電残基を有するアミノ酸の７アミノ酸繰り返しであるコイルドコイルの成果を伴い、そしてオリゴマー状態及びらせん方向に影響を及ぼす第一次決定基である「ａ」位及び「ｄ」位のアミノ酸を伴い、オリゴマーを形成するために互いに巻き付く２つ又はそれ以上のらせんを含んでいることが知られている（例えば、Akey et al., 2001, Biochemistry, 40:6352-60 を参照されたい）。]
[0035] 「ａ」及び「ｄ」位を含む多くの位置の各種アミノ酸を置換することによるモデルコイルドコイルの安定性及びオリゴマー状態に対する影響は、既に報告されている。そこでは、三量体構造の形成が特に「ｄ」位の置換よって決定されている（例えば、Tripet et al., J. Mol. Biol. 300:377-402 (2000); Wagschal et al., J. Mol. Biol, 285:785-803 (2000); and Dwyer et al., PNAS USA. 104:12772-12777 (2007) を参照されたい）。]
[0036] 抗ウィルス活性（過度な実験を行わずに当該技術分野で標準的な方法を方法を用いて測定できるよなうな）を有していて、領域の全て又は画分を含有している、ＨＩＶｇｐ４１のＨＲ１ドメイン又はＨＲ２ドメインの元の配列から得られる何れのペプチドも、１つ又はそれ以上のアミノ酸置換、好ましくは同種置換をその中で行う元の配列として用い、ドメイン中では本発明で提供される合成ペプチドを産生するために導入できることは、当業者にとって明らかであろう。
説明の目的で、元の配列から得られるそのようなＨＲ２ペプチド、及びそれから合成ペプチドが得られることが、これに限定されないが、図５及び６の説明に含まれている。]
[0037] 幾つかのＨＲ及びＨＲ類縁ドメイン残基は置換傾向が低いが、その他のものは変化をより受け入れるということは当業者に明らかである。例えば、７アミノ酸繰り返しのａ及びｄ位のアミノ酸を変異しないこと又は同類変異のみを行うことが好ましい（図９を参照されたい）。
一態様では、７アミノ酸繰り返しドメインは式：ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ（式中の、ａ及びｄは疎水性アミノ酸である）：を有している。
更なる態様では、７アミノ酸繰り返しドメインは式：ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ：の２回又はそれ以上の反復を有している。
例えば、一態様では、ＨＲドメインは図９に示されている配列又はそれらの同類置換を有することことができる。
従って、ＨＲ及びＨＲ様ドメインはアミノ酸配列における有意な変動性を有しているが、らせん構造及び抗ウィルス活性を保持できる。] 図９
[0038] 一態様では、改変ポリペプチドは式：ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ、ｆ、ｇ（式中の、ａ及びｄは疎水性アミノ酸残基であって、ｂ、ｃ、ｅ、ｆ及びｇは何れかのアミノ酸である）：を有する７アミノ酸繰り返しドメインを包含している。この式が２回又はそれ以上平行に反復することが好ましい。]
[0039] 例えば、更なる態様では、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは式：Ｗ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｗ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｙ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｌ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｓ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｑ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｎ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｅ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｌ（ａ）、又はそれらの同類アミノ酸置換（式中の、ｂ、ｃ、ｅ、ｆ及びｇは何れかのアミノ酸であってよい）：を有している。]
[0040] 更なる態様では、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは式：Ｔ（ｇ）、Ｗ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｗ（ｄ）、Ｄ（ｅ）、Ｒ（ｆ）、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｙ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｌ（ｄ）、Ｉ（ｅ）、ｆ、ｇ、ａ、Ｑ（ｂ）、ｃ、ｄ、Ｑ（ｅ）、Ｅ（ｆ）、Ｋ（ｇ）、ａ、Ｅ（ｂ）、ｃ、ｄ、Ｌ（ｅ）、ｆ、Ｅ（ｇ）、Ｌ（ａ）、又はそれらの同類アミノ酸置換（ここにおいて、指摘されていないアミノ酸は何れのアミノ酸であってもよい）：を有している。]
[0041] ＨＲ、ＨＲ様及びＨＲ類縁ドメインを、当業者は、配列相同性、構造相同性及び／又は機能相同性に基づく配列によって容易に特定可能である。このような方法は当該技術分野で周知であって、残基対の相関関係に基づく生物情報プログラム（例えば、:ch.embnet.org/software/COILS_form.htmlのワールドワイドウェブ上の）を包含していて、これはタンパク質配列からのコイルドコイルを認識してそれらの構造をモデル化する能力を有している（Lupas, A., et al. Science 1991. 252(5009): p. 1162-1164 を参照されたい）。ＨＲ、ＨＲ様及びＨＲ類縁ドメインを特定する更なる方法は、米国特許第６，８２４，７８３号、米国特許第７，２７３，６１４号、米国特許第５，４６４，９３３号、及び米国特許第７，１２２，１９０号に記載されていて、これらの全てが、その全てを参照として本明細書に組み込まれている。]
[0042] 一態様では、本発明の改変ポリペプチドは、相互作用表面（interacting face）で、配列番号１〜１４、図５又は図６のアミノ酸配列と７０％又はそれ以上類似している。
αらせんの「相互作用表面」は、別のアミノ酸残基と相互作用するアミノ酸残基を包含している。例えば、ＨＩＶｇｐ４１ＨＲ−２ドメインの相互作用表面は、「ａ」及び「ｄ」位のアミノ酸を包含している（図４Ａ及び９を参照されたい）のに対して、ＨＩＶｇｐ４１ＨＲ−１ドメインの相互作用表面はＨＲ−２と相互作用するｅ、ｇ位のアミノ酸及びＨＲ１−ＨＲ１相互作用に関与するａ、ｄを包含している（図４Ａを参照されたい）。７アミノ酸繰り返し及び相互作用表面残基を特定する方法は当該技術分野において周知であって、本明細書に記載されている。] 図４Ａ
[0043] 「ＨＩＶのＨＲ−１ドメイン」又は「ＨＩＶの７回反復１ドメイン」は、正確に折り畳まれたときにαらせんを形成する、ＨＩＶのｇｐ４１タンパク質のＮ末端部分（ＨＩＶエンベロープの膜貫通サブユニット）である。ＨＩＶｇｐ４１のＨＲ−１ドメインは５〜５５の間のアミノ酸残基を包含でき、そしてＨＩＶｇｐ４１の天然型ＨＲ−１ドメインの配列、又はそれらの組み合わせ若しくはキメラに基づいている。
ＨＩＶのＨＲ−１ドメインは、アミノ酸残基５４６〜５８１ＨＩＶ−１ Ｅｎｖを含むＮ３６ドメインを包含することができる（図２及び Bewley et al., J. Biol. Chem. 277:14238-14245 (2002) を参照されたい）。
ＨＲ−１ドメインポリペプチドは当該技術分野で公知であり、そして本明細書に記載されている。一態様では、ＨＲ−１ドメインは配列番号２又は１４と３０％又はそれ以上同一のアミノ酸配列を有している。] 図２
[0044] 「ＨＩＶのＨＲ−２ドメイン」又は「ＨＩＶの７回反復２ドメイン」は、正確に畳み込まれたときにαらせんを形成する、ＨＩＶのｇｐ４１タンパク質のＣ末端部分（ＨＩＶエンベロープの膜貫通サブユニット）である。
ＨＩＶのＨＲ−２ドメインは、ＨＩＶ−１ Ｅｎｖのアミノ酸残基６２８〜６６１を含むＣ３４ドメインを包含することができる（図２を参照されたい）。
ＨＲ−２ドメインポリペプチドは当該技術分野で公知であり、そして本明細書に記載されている。一態様では、ＨＲ−２ドメインは配列番号１又は１３と４０％又はそれ以上同一のアミノ酸配列を有している。] 図２
[0045] 本発明のポリペプチドに関連して本明細書で用いられる用語、「キメラ」又は「キメラの」は、少なくとも２つの異なったＨＲドメインを有するか、又は天然では見られない方法で結合している単一のＨＲドメイン領域を有しているポリペプチドを示す（図８）。例えば、キメラポリペプチドはＨＩＶｇｐ４１ ＨＲ−２ドメインの第１部分及びＳＩＶ ｇｐ４１ ＨＲ−２の第２部分を有することができる。
これらのキメラポリペプチドは、天然では生じないコード配列をもたらすように共に融合又は連結することができるヌクレオチド配列によってコードされる。
キメラは、野生型ＨＲポリペプチド(ＨＩＶ−１ ｇｐ４１ ＨＲ−２）と実質的に類似していてもよく、類似の活性（すなわち、野生型ＨＲの活性、例えば、融合、ウィルス感染性の阻害の最も好ましくは９０％、より好ましくは７０％、好ましくは４０％、又は少なくとも１０％）を保有している、任意の機能性誘導体、断片、変異体、類縁体、又は化学誘導体を包含する。] 図８
[0046] 本明細書で用いられる「治療する」及び「治療」は、病気の進行又は悪化を減少する、抑制する、軽減する、低下する、停止する又は安定化すること、或いはウィルス性疾患に罹病している動物において病的細胞（例えば、感染細胞）の発生を減少させることを意味することとする。治療は、例えば、対象におけるＨＩＶの完全欠損で完了できる。治療は、対象における感染細胞の発生が、本発明を行わないで発生すると思われるものより少ないというように、部分的であってもよい。治療は感染細胞の安定化、減少又は除去、患者の生存率の増大、若しくは疾患の少なくとも１つの徴候又は症状の減少をもたらす。]
[0047] 本明細書で用いられる用語「予防する」、「予防すること」、及び「予防」は、対象における疾患の発生の減少、病気に罹る危険性の減少、又は病気の少なくとも１つの徴候又は関連症状の提示の減少を示すこととする。予防は、対象において疾患又は病的細胞の完全欠損で完了できる。予防は、対象における疾患又は病的細胞の発生が、本発明を行わないで発生すると思われるものより少ないというように、部分的であってもよい。]
[0048] ウィルス感染に関連して本明細書で用いられる用語「阻害する」は、ウィルス伝播の減少、ウィルスの細胞内標的への結合の減少、又は疾患の減少を示す。
例えば、本発明のポリペプチドは、ウィルス伝播、合胞体形成、及びウィルスに関連する疾患（例えば、ＡＩＤＳ）を阻害するために用いられる。
本発明の化合物を、化合物がウィルス（例えば、感染性、伝播、等）を阻害するか否かを確認するために、当該技術分野で公知で本明細書に記載されている、多くのアッセイによってスクリーニングすることができる。例えば、ウィルスと培養している細胞培養を試験化合物と接触させて、本発明の化合物をウィルスの感染性を阻害する能力について試験することができる。適切なコントロール（阻害剤に曝されていない細胞の数）と比較して、試験化合物の存在下でウィルス感染性が９０％、８０％、７５％、７０％、６０％、５０％、４０％、３０％、２０％、１０％、５％、又はそれ以下の場合に、化合物がウィルス感染を阻害することが分かる。]
[0049] 本明細書で用いられる用語「伝播を阻害する」は、例えば、細胞−細胞融合による細胞のウイルス感染を阻害するか、又はウィル感染を取り除く薬剤の能力を示す。このような感染は、エンベロープを持ったウィルスの場合に生ずるような、膜融合、又はウィルス構造及び細胞構造に関連するその他の融合事象に関連してもよい。]
[0050] 本明細書で用いられる用語「合胞体形成を阻害すること」は、薬剤の非存在下での２つ又はそれ以上の部分で生じる膜融合のレベルと比べて、２つ又はそれ以上の部分の間の膜融合事象のレベルを阻害又は減少する薬剤の能力を示す。この部分は、例えば、細胞膜又はウィルスエンベロープのようなウィルス構造であってよい。]
[0051] 用語「有効量」、又は「有効用量」は、意図した薬理学的、治療的又は予防的結果を生じさせる薬剤の量を示す。薬理学的有効量は、ウィルス性疾患の１つ又はそれ以上の症状の改善をもたらすか、又はウィルス性疾患の進展を予防するか、又は疾患の軽減を引き起こすか、或いはウィルスの伝播を減少する。
例えば、治療有効量が、少なくとも５％、好ましくは少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、少なくとも５０％、少なくとも５５％、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、又はそれ以上にまで、伝播の速度を減少するか、又はＨＩＶウィルスの量を減少するか、或いは感染細胞の数を減少する、治療薬の量を示すことが好ましい。
ＨＩＶに関連する治療有効量も、少なくとも５％、好ましくは少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、少なくとも５０％、少なくとも５５％、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、又はそれ以上にまで、ＣＤ４＋細胞数を増大する、ＡＩＤＳに進行するまでの時間を長くするか、又は生存期間を延ばすことを示している。]
[0052] 用語「アミノ酸」はアミノ基とカルボキシル基の両方を含有している分子を示す。適切なアミノ酸は、これに限定されないが、ペプチド中に見出される２０個の通常の天然アミノ酸（例えば、Ａ、Ｒ、Ｎ、Ｃ、Ｄ、Ｑ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｌ、Ｋ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｓ、Ｔ、Ｗ、Ｙ、Ｖ（１文字略号として知られている））の、更に有機合成又はその他の代謝経路で製造される天然又は非天然アミノ酸のＤ−及びＬ−異性体の両方を包含する。]
[0053] 「非必須」アミノ酸残基は、ポリペプチドの野生型配列（例えば、ＨＲ−１又はＨＲ−２ドメイン）から、その活性／二次構造（αらせん構造）を消失又は実質的に変えずに、改変できる残基である。
「必須」アミノ酸残基は、ポリペプチド野生型配列から改変すると、ポリペプチドの活性及び／又は二次構造の消失又は実質的な消失をもたらす、残基である。
実質的な消失は、適切なアッセイ（例えば、合胞体形成アッセイ、ウィルス融合アッセイ）において、ペプチドの活性を野生型ペプチドの約３０％未満、約２０％未満、約１０％未満、約５％未満に減少させることと理解される。
ＨＲ及びＨＲ様ドメインの必須及び非必須アミノ酸残基は、当該技術分野で周知で本明細書に記載されている方法によって容易に確認することができる。
一態様では、必須アミノ酸残基は、７アミノ酸繰り返しドメインの「ａ」又は「ｄ」位にあるのに対して、非必須アミノ酸は「ｂ」、「ｃ」、［ｅ」、「ｆ」、又は「ｇ」位に存在できる（図９）。 本明細書で用いる用語「必須」アミノ酸残基は、必須アミノ酸の同類置換を包含する。一般に、「必須」アミノ酸残基はαらせんの相互作用表面に見出される。例えば、ＨＩＶｇｐ４１ ＨＲ−２ドメインでは、相互作用表面は「ａ」及び「ｄ」位アミノ酸を包含している（図４Ａ及び９を参照されたい）。
別の態様では、改変ポリペプチドは、Ｌｅｕ−５５６、Ｌｅｕ−５６５、Ｖａｌ−５７０、Ｇｌｙ−５７２、及びＡｒｇ−５７９を有しているｇｐ４１ ＨＲ−１ドメインを含有している（Lu, M., et al., J. Vir. 2001. 75(22): p. 11146-11156）。] 図４Ａ 図９
[0054] 「同類アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸と置き換えられていることである。例えば、類似の側鎖を有しているアミノ酸残基のファミリーが当該技術分野で定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β分枝側鎖（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）及び芳香族側鎖（チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を持つアミノ酸を包含している。
その他の同類アミノ酸置換は、ペプチドの電荷を修正するためにアスパラギン酸をアスパラギンで置き換えるように、アミノ酸側鎖ファミリーを越えて行うこともできる。従って、ＨＲドメインポリペプチド中の予測できる非必須アミノ酸を、例えば、同じ側鎖ファミリーの別のアミノ酸と、又はファミリーを越えた同族体と（例えば、アスパラギン酸をアスパラギンで、グルタミン酸をグルタミンで）置き換えることが好ましい。]
[0055] 本明細書で用いられる用語「同一性」又は「パーセント同一性」は、２つの重合分子、例えば、２つのポリヌクレオチド又は２つのポリペプチドの間のサブユニット配列の類似性を示す。２つの分子の両方にあるサブユニットの位置が、同じ単量体サブユニットで占められている場合、例えば２つのペプチドのそれぞれの位置がセリンによって占められている場合、これらはその位置で同一である。２つの配列間の同一性は、整合数又は同一位置の一次関数である。例えば、２つのペプチド又は化合物の配列の位置の半分（例えば、長さが１０サブユニットのポリマー中５つの位置）が同一なら、２つの配列は５０％同一であり：位置の９０％、例えば１０個のうち９つが整合すれば、２つの配列は９０％の配列同一性を共有している。
２つの配列間の同一性は整合数又は同一位置数の一次関数である。従って、参照配列の部分が特定のペプチドにおいて削除されている場合は、その削除された部分は配列同一性を計算する目的ではカウントされない。
同一性は多くの場合、配列分析ソフトウェア、例えば、ＢＬＡＳＴＮ又はＢＬＡＳＴＰ（米国政府（".gov"）の国立衛生研究所（".nih"）の全米バイオテクノロジー情報センター（".ncbi"）のワールドワイドウェブサイト（"www"）の”Ｂｌａｓｔ”ディレクトリー（"/BLAST/"）から入手可能）を用いて測定されている。
ＢＬＡＳＴＮ（ヌクレオチド配列用）によって２つの配列を比較する（例えば、互いに２つの配列を”Ｂｌａｓｔ”−ｉｎｇ）ための初期パラメータは、マッチしたときの得点＝１、ミスマッチしたときのペナルティー＝−２、オープンギャップ＝５、拡張ギャップ＝２である。
タンパク質配列のためにＢＬＡＳＴＰを使用するときの初期パラメータは、マッチしたときの得点＝０、ミスマッチしたときのペナルティー＝０、オープンギャップ＝１１、拡張ギャップ＝１である。
更に、同一性を確認するコンピュータプログラムは当該技術分野で公知である。]
[0056] ２つ又はそれ以上のポリペプチド配列との関連で、「類似性」又は「パーセント類似性」は、同一であるか又は特定パーセントのアミノ酸残基又はそれらの同類置換を有している２つ又はそれ以上の配列又は部分配列を示し、それは以下の配列比較アルゴリズムのうちの１つを用いるか、又は目視検査で測定すると、最大一致を比較及び位置合わせしたときに同一である。
例として、当該技術分野で公知で本明細書に記載されているコンピュータ類似性プログラムによって位置合わせをして、第１ポリペプチドに含まれている数と同じ数のアミノ酸の配列の何れかと比較したときに、第１ポリペプチドのアミノ酸配列が、ＨＩＶ−１ ＨＲ−１ドメインの領域と少なくとも２０％、５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、９０％、又は９５％若しくはそれ以上も同一、又は同類置換されているときに、第１ポリペプチドはＨＩＶ−１ ＨＲ−１ドメインと類似していると見なすことができる。
第１タンパク質と第２タンパク質のポリペプチド領域が１つ又はそれ以上の同類アミノ酸残基を含んでいることが好ましい。]
[0057] 本明細書で用いられる「抗体」は、抗原に対する結合親和性を有する、Ｆａｂ分子、Ｆａｂタンパク質、単鎖ポリペプチド、又は多機能性抗体のような、抗体のいずれかの反応性断片（複数を含む）を包含する。この用語は、キメラ抗体、変性抗体、１価抗体、二重特異性抗体、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ヒト型抗体、及びヒト化抗体を包含する。抗体の作成方法は当該技術分野で周知である。]
[0058] 記号]
[0059] ]
[0060] は、分子構造の１部として用いられるとき単一結合又はトランス或いはシス二重結合を示す。]
[0061] 用語「アミノ酸側鎖」は、アミノ酸のα−炭素に付加している部分を示す。例えば、アラニンのアミノ酸側鎖はメチルであり、フェニルアラニンのアミノ酸側鎖はフェニルメチルであり、システインのアミノ酸側鎖はチオメチルであり、アスパラギン酸のアミノ酸側鎖はカルボキシメチルであり、チロシンのアミノ酸側鎖は４−ヒドロキシフェニルメチルである等である。その他の非天然アミノ酸側鎖、例えば、天然に生じるもの（例えばアミノ酸代謝物）又は合成されるもの（例えば、α−ジ置換アミノ酸）も包含される。]
[0062] 用語ポリペプチドは、共有結合（例えば、アミド結合）で結合している２個又はそれ以上の天然又は合成アミノ酸を含んでいる。本明細書に記載されているようなポリペプチドは全長タンパク質（例えば、十分に加工されたタンパク質）を、更により短いアミノ酸配列（例えば、天然タンパク質の断片、又は合成ポリペプチド断片）も包含する。]
[0063] 用語「ハロ」は、フッ素、塩素、臭素又はヨウ素の何れかのラジカルを示す。
用語「アルキル」は、指示されている数の炭素原子を含有し、直鎖又は分枝鎖であってよい、炭化水素鎖を示す。例えば、Ｃ１〜Ｃ１０はその中に１〜１０個（合計）の炭素原子を有してもよい基を示す。数字表示が何も存在しないときは、「アルキル」はそこに１〜２０個（合計）の炭素原子を有している鎖（直鎖又は分枝鎖の）である。
用語「アルキレン」は、２価のアルキル（すなわち、−−Ｒ−−）である。]
[0064] 用語「アルケニル」は、１つ又はそれ以上の炭素‐炭素の二重結合を有する直鎖又は分枝鎖であってよい炭化水素鎖を示す。アルケニル部分は指示されている数の炭素原子を含有している。例えば、Ｃ２〜Ｃ１０はその基がその中に２〜１０個（合計）の炭素原子を有していいてもよいということを表示している。用語「低級アルケニル」は、Ｃ２〜Ｃ８アルケニル鎖を示す。数字表示が何も存在しないときは、「アルケニルは」その中に２〜２０個（合計）の炭素原子を有している鎖（直鎖又は分枝鎖の）である。]
[0065] 用語「アルキニル」は、１つ又はそれ以上の炭素‐炭素の三重結合を有する直鎖又は分枝鎖であってよい炭化水素鎖を示す。アルキニル部分は指示されている数の炭素原子を含有している。例えば、Ｃ２〜Ｃ１０はその基がその中に２〜１０個（合計）の炭素原子を有していいてもよいということを表示している。用語「低級アルキニル」は、Ｃ２〜Ｃ８アルキニル鎖を示す。数字表示が何も存在しないときは、「アルケニル」はその中に２〜２０個（合計）の炭素原子を有している鎖（直鎖又は分枝鎖の）である。]
[0066] 用語「アリール」は、炭素６個の単環式又は炭素１０個の２環式芳香族環系を示し、そこではそれぞれの環の０、１、２、３、又は４個の原子が置換基で置換されていてもよい。アリール基の例は、フェニル、ナフチル等を包含する。
用語「アリールアルキル」又は用語「アラルキル」は、アリールで置換されているアルキルを示す。
用語「アリールアルコキシ」はアリールで置換されているアルコキシを示す。]
[0067] 本明細書で用いられているような用語「シクロアルキル」は、３〜１２個の炭素、好ましくは３〜８個の炭素、そしてより好ましくは３〜６個の炭素を有している飽和及び部分不飽和の環状炭化水素基を包含し、ここではシクロアルキル基は更に任意に置換されていてもよい。好ましいシクロアルキル基は、これに限定されないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロへプチル、及びシクロオクチルを包含する。]
[0068] 用語「ヘテロアリール」は、５〜８員の単環式、８〜１２員の二環式、又は１１〜１４員の三環式の環系を示し、単環式の場合は１〜３個のヘテロ原子、二環式の場合は１〜６個のヘテロ原子、また三環式の場合は１〜９個のヘテロ原子を有している。当該ヘテロ原子はＯ、Ｎ、又はＳから選ばれ（例えば、単環式、二環式、又は三環式の場合それぞれに、炭素原子と１〜３個、１〜６個、又は１〜９個のＮ、Ｏ、又はＳのヘテロ原子）、そこでは、それぞれの環の０、１、２、３、又は４個の原子が置換基で置換されていてもよい。ヘテロアリール基の例は、ピリジル、フリル又はフラニル、イミダゾリル、ベンズイミダゾリル、ピリミジニル、チオフェニル又はチエニル、キノリニル、インドリル、チアゾリル等を包含する。
用語「ヘテロアリールアルキル」又は用語「ヘテロアラルキル」は、ヘテロアリールで置換されているアルキルを示す。
用語「ヘテロアリールアルコキシ」は、ヘテロアリールで置換されているアルコキシを示す。]
[0069] 用語「ヘテロシクリル」は、非芳香族の５〜８員の単環式、８〜１２員の二環式、又は１１〜１４員の三環式の環系を示し、単環式の場合は１〜３個のヘテロ原子、二環式の場合は１〜６個のヘテロ原子、また三環式の場合は１〜９個のヘテロ原子を有している。当該ヘテロ原子はＯ、Ｎ、又はＳから選ばれ（例えば、単環式、二環式、又は三環式の場合それぞれに、炭素原子と１〜３個、１〜６個、又は１〜９個のＮ、Ｏ、又はＳのヘテロ原子）、そこでは、それぞれの環の０、１、２、又は３個の原子が置換基で置換されていてもよい。ヘテロシクリル基の例は、ピペラジニル、ピロリジニル、ジオキサニル、モルホリニル、テトラヒドロフラニル等を包含する。]
[0070] 用語「置換基」は、アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロシクリル、又はヘテロアリール基の何れかの原子が「置換されている」基を示す、適切な置換基は、これに限定されないが、ハロ、ヒドロキシ、メルカプト、オキソ、ニトロ、ハロアルキル、アルキル、アルカリール、アリール、アラルキル、アルコキシ、チオアルコキシ、アリールオキシ、アミノ、アルコキシカルボニル、アミド、カルボキシ、アルカンスルホニル、アルキルカルボニル、及びシアノ基を包含する。]
[0071] 本明細書で示されている範囲は、範囲内の全ての値を省略していると理解される。例えば、範囲１〜５０は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、又は５０よりなる群からの何れかの数、数の組み合わせ、又は下位の範囲を含んでいるものと理解される。]
[0072] 明確に指示されているか又は内容から明瞭である場合以外は、本明細書で用いられる用語「又は」は、全てを含んでいると理解される。]
[0073] 明確に指示されているか又は内容から明瞭である場合以外は、本明細書で用いられる用語「ある（ａ、ａｎ）」、「その（ｔｈｅ）」は単数又は複数であると理解される。]
[0074] 明確に指示されているか又は内容から明瞭である場合以外は、本明細書で用いられる用語「約」は、当該技術分野における通常の許容範囲内、例えば、平均値の２標準偏差内であるのように理解される。約は、表示されている値の、１０％、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％、１％、０．１％、０．５％、０．１％、０．０５％、又は０．０１％内であるのように理解される。]
[0075] 本明細書の可変基の何れかの定義内の化学基の列挙は、単一の基又は列挙されている基の組み合わせの何れかとしての可変基の定義を包含している。本明細書の可変基についての実施形態又は態様の記載は、何れかの単一の態様又は他の態様若しくはそれらの部分との組み合わせとしての態様を包含している。]
[0076] 本明細書に示されている組成物又は方法を、本明細書に示されている組成物又は方法の１つ又はそれ以上と組み合わせることができる。]
[0077] ポリペプチド
抗ウィルス活性を示す改変ポリペプチドが本明細書に記載されている。改変ポリペプチドが、ウィルスコートタンパク質を妨げることによって、ウィルスと細胞の融合を阻害するそれらの能力を介して抗ウィルス活性を示すと考えられている。本発明の改変ポリペプチドは、ウィルス由来の安定化αらせん７アミノ酸繰り返しドメインを含有できる。このαらせん７アミノ酸繰り返しドメインを炭化水素架橋で安定化することが好ましい。適切なウィルス性αらせん７アミノ酸繰り返しドメインは、細胞への接着又は侵入に直接又は間接的に関わっている、αらせんドメインを有している何れかのウィルス（例えば、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、コロナウィルス、エボラウィルス、ＨＩＶ）から得ることができる。]
[0078] 動作理論に限定されないが、本明細書に記載されている改変ポリペプチドの強力な抗ウィルス活性を説明するために以下のモデルを提示する。安定化ペプチドとして合成されると、本発明の改変ポリペプチドは、恐らくウィルスのグリコプロテインと複合体を形成して、融合（fusogenic)過程；例えば元の構造から融合状態へのウィルスタンパク質の構造推移の間の；を妨げるそれらの能力によって、ウィルス感染及び融合の強力な阻害剤となる。理論に縛られないが、改変ペプチドは、ウィルスのグリコプロテイン上のそれぞれの結合部位に接近して、ウィルスが細胞と融合することを阻害する破壊的な影響を及ぼすと考えられる。この改変ポリペプチドは、それらの増大した安定性及び有効性によって、特に有用である。]
[0079] 第１の態様では、本発明は、安定なウィルス性αらせん７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、ＨＲ−１、ＨＲ−２、ＨＲ様又はＨＲ類縁）又はそれらの活性断片を有している改変ポリペプチドを対象としている。改変ポリペプチドはＨＲドメインのキメラも含有できる。適切なウィルス性αらせん７アミノ酸繰り返しドメインは、細胞への接着又は侵入に直接又は間接的に関わっているαらせんドメインを有する何れかのウィルスから得られる。]
[0080] 別の態様では、本発明は、安定なＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン（例えば、ＨＩＶ−１又はＨＩＶ−２の７アミノ酸繰り返しドメイン１又は２）を有している改変ポリペプチドを対象としている。７アミノ酸繰り返し−１及び７アミノ酸繰り返し−２ドメインのアミノ酸配列は当該技術分野で周知であって、それぞれ配列番号２及び配列番号１で示されるものを含んでいる。
一態様では、７アミノ酸繰り返しドメイン１は、配列番号２、配列番号３又は配列番号１４のアミノ酸配列と、３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成する。また、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返し１ドメインは、相互作用表面の残基が配列番号１又は２のそれと同一であるか或いはそれらの同類置換である限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を同定する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0081] 別の態様では、７アミノ酸繰り返しドメイン２は、図４、図６又は配列番号１のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成する。また、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返し２ドメインは、相互作用表面の残基が配列番号１又は２のそれと同一であるか或いはそれらの同類置換を有する限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を同定する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0082] 一態様では、改変ポリペプチドは、式：ａｂｃｄｅｆｇ（式中の、ａ及びｄは疎水性アミノ酸残基を、ｂ、ｃ、ｅ、ｆ及びｇは何れかのアミノ酸である）：を有する７アミノ酸繰り返しドメインを包含している。式が２回又はそれ以上平行に反復することが好ましい。]
[0083] 例えば、更なる態様では、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは式：Ｗ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｗ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｙ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｌ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｓ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｑ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｎ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｅ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｌ（ａ）（式中の、ｂ、ｃ、ｅ、ｆ及びｇは何れかのアミノ酸であってよい）：又はそれらの同類アミノ酸置換を有している。]
[0084] 更なる態様では、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは、式：Ｔ（ｇ）、Ｗ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｗ（ｄ）、Ｄ（ｅ）、Ｒ（ｆ）、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｙ（ｄ）、ｅ、ｆ、ｇ、Ｉ（ａ）、ｂ、ｃ、Ｌ（ｄ）、Ｉ（ｅ）、ｆ、ｇ、ａ、Ｑ（ｂ）、ｃ、ｄ、Ｑ（ｅ）、Ｅ（ｆ）、Ｋ（ｇ）、ａ、Ｅ（ｂ）、ｃ、ｄ、Ｌ（ｅ）、ｆ、Ｅ（ｇ）、Ｌ（ａ）：又はそれらの同類アミノ酸置換を有し、そして式中の指定されていないアミノ酸は何れのアミノ酸であってもよい。]
[0085] 別の態様では、本発明の改変ポリペプチドは、配列番号１〜１４、図５又は図６のアミノ酸配列の相互作用表面と同一のアミノ酸残基、又はそれらの同類置換を有している。αらせんの「相互作用表面」は、コイルドコイル構造中の別のアミノ酸残基と相互作用するアミノ酸残基である。例えば、ＨＩＶｇｐ４１ＨＲ−２ドメインでは、相互作用表面が「ａ」及び「ｄ」位置のアミノ酸を包含している（図４Ａ及び９を参照されたい）のに対して、ＨＩＶｇｐ４１ＨＲ−１ドメインの相互作用表面は、ＨＲ２と相互作用するｅ、ｇ位置及びＨＲ１−ＨＲ１相互作用に関与するａ、ｄ位置のアミノ酸を包含している（図４Ａを参照されたい）。７アミノ酸繰り返し及び相互作用表面残基を同定する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。] 図４Ａ
[0086] αらせん７アミノ酸繰り返しドメインを炭化水素架橋で安定化することが好ましい（例えば、図１０）。改変ポリペプチドの何れかでの使用に適している炭化水素架橋は、本明細書及び米国特許出願公開第２００５／０２５０６８０号（これは参照としてその全部が本明細書に取り込まれている）に記載されている。炭化水素架橋は、ポリペプチドが、αらせん二次構造を有し、その元のαらせん配置を保持し、そしてその安定性及び有効性を増大し易くする。
一態様では、改変ポリペプチドは、円偏光２色性を測定すると、水溶液中で少なくとも１０％、２０％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、６０％、７０％、８０％、又は９０％或いはそれ以上のらせん構造を有している。円偏光２色性を測定するアッセイは、当該技術分野で公知であって、本明細書に記載されている。] 図１０
[0087] 炭化水素で架橋されたポリペプチドは、２つのアミノ酸の間に鎖（連鎖）を含有していて、この鎖がポリペプチドのαらせん二次構造を有意に強める。一般に、この鎖は、１つ又は２つのらせん回転の長さ（すなわち、約３．４又は約７アミノ酸）に広がっている。従って、ｉ及びｉ＋３；ｉ及びｉ＋４；又はｉ及びｉ＋７に位置するアミノ酸が、化学修飾及び架橋のための理想的な候補である。それ故に、本発明の改変ポリペプチドの何れのアミノ酸残基も、上記に準拠して繋げる（例えば、架橋する）ことができる。適切な鎖は、本明細書及び米国特許出願公開第２００５／０２５０６８０号に記載されている。]
[0088] 更なる態様では、炭化水素架橋は、第１アミノ酸（ｉ）と第１アミノ酸からアミノ酸３個下流にある第２アミノ酸（ｉ＋３）を結合するように位置している。
別の態様では、炭化水素架橋は、第１アミノ酸（ｉ）と第１アミノ酸からアミノ酸４個下流にある第２アミノ酸（ｉ＋４）を結合する。
更に別の態様では、炭化水素架橋は、第１アミノ酸（ｉ）と第１アミノ酸からアミノ酸７個下流にある第２アミノ酸（ｉ＋７）を結合する。]
[0089] 更なる態様では、配列：
ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又は
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ
（式中のＸは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである）：
を有する７アミノ酸繰り返しドメインを包含している。]
[0090] 改変ポリペプチドは一般に、本明細書に記載されているような、式（Ｉ）、（ＩＩ）又は（ＩＩＩ）の構造を有している。]
[0091] 本発明は、とりわけ、ウィルスの細胞への接着及び／又は融合に直接的又は間接的のどちらかで関わっている、αらせんドメインを有するその他のウィルス由来の改変ポリペプチドも対象としている。例えば、本発明の一態様は、呼吸器合胞体ウィルス由来である安定なウィルスαらせん(例えば、７アミノ酸繰り返しドメイン）を有する改変ポリペプチドを対象にしている。αらせんは、ウィルス感染性に関与するＲＳＶ由来のαらせんドメインの何れかを含んでいてもよい。適切なＲＳＶαらせんドメインは、
ＹＴＳＶＩＴＩＥＬＳＮＩＫＥＮＫＣＮＧＴＤＡＫＶＫＬＩＫＱＥＬＤＫＹＫＮＡＶＴＥＬＱＬＬＭＱＳＴ（配列番号４）；
ＦＹＤＰＬＶＦＰＳＤＥＦＤＡＳＩＳＱＶＮＥＫＩＮＱＳＬＡＦＩＲＫＳＤＥＬＬ（配列番号５）；
ＳＧＩＡＶＳＫＶＬＨＬＥＧＥＶＮＫＩＫＮＡＬＬＳＴＮＫＡＶＶＳＬＳＮＧＶＳＶＬＴＳＫＶＬＤＬＫＳＹＩＮＮＱＬＬＰＩ−（配列番号１１）又は
ＰＩＩＮＹＹＤＰＬＶＦＰＳＤＥＦＤＡＳＩＳＱＶＮＥＫＩＮＱＳＬＡＦＩＲＲＳＤＥＬＬＨＮＶＮＴＧＫＳＴＴＮＩＭ（配列番号１２）と３０％又はそれ以上同一であるものを包含し、αらせんを形成する。]
[0092] また、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返し類縁ドメインは、相互作用表面の残基が配列番号４、５、１１及び１２のそれと同一であるか又はそれらの同類置換である限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返し類縁体の相互作用表面を確認する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0093] 更に別の態様では、本発明は、パラインフルエンザウィルス由来の安定なウィルス性αらせん７アミノ酸繰り返しドメインを有している改変ポリペプチドを対象にしている。適切なパラインフルエンザウィルスの７アミノ酸繰り返しドメインは、
ＡＬＧＶＡＴＳＡＱＩＴＡＡＶＡＬＶＥＡＫＱＡＲＳＤＩＥＫＬＫＥＡＩＲ（配列番号６）
と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成するようなものを包含する。]
[0094] また、改変パラインフルエンザポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは、相互作用表面の残基が配列番号６の残基と同一であるか又はそれらの同類置換である限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を確認する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0095] 別の態様では、本発明はパラミクソウィルス、オルトミクソウィルス、コロナウィルス、及びフィロウィルス由来の安定化ウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメインを有している改変ポリペプチドを対象にしている。]
[0096] コロナウィルスのαらせん７アミノ酸繰り返しドメインは当該技術分野で公知であって、
ＮＶＬＹＥＮＱＫＱＩＡＮＱＦＮＫＡＩＳＱＩＱＥＳＬＴＴＴＳＴＡＬＧＫＬＱＤＶＶＮＱＮＡＱＡＬＮＴＬＶＫＱＬＳＳＮＦＧＡＩＳＳＶＬＮＤＩＬＳＲＬＤＫＶＥＡＥ（配列番号７）又は
ＴＳＰＤＶＤＦＧＤＩＳＧＩＮＡＳＶＶＮＩＱＫＥＩＤＲＬＮＥＶＡＫＮＬＮＥＳＬＩＤＬＱＥＬＧＫＹ（配列番号８）と３０％又はそれ以上同一であり、そしてαらせんを形成する。]
[0097] また、改変コロナウィルスポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは、相互作用表面の残基が配列番号７及び８のそれらと同一であるか又はそれらの同類置換である限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を確認する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0098] 同様に、フィロウィルスのαらせん７アミノ酸繰り返しドメインは当該技術分野で公知であって、
ＤＧＬＩＣＧＬＲＱＬＡＮＥＴＴＱＡＬＱＬＦＬＲＡＴＴＥＬＲＴＦＳＩＬＮＲＫＡＩＤＦＬＬ（配列番号９）又は
ＤＷＴＫＮＩＴＤＫＩＤＱＩＩＨＤＦＶＤＫＴＬＰＤ（配列番号１０）と３０％又はそれ以上同一のものを包含し、そしてαらせんを形成する。]
[0099] また、改変フィロウィルスポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは、相互作用表面の残基が配列番号１０のそれと同一であるか又はそれらの同類置換である限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を同定する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0100] インフルエンザウィルスの７アミノ酸繰り返しドメインも当該技術分野で公知である。例えば、インフルエンザＡウィルス（Ａ／Ａｉｃｈｉ／２／６８株）中の７アミノ酸繰り返しドメインは、残基３７９〜４３６、３８７〜４５３、及び３８０〜４５６に生じる。同様に、残基３８３〜４７１が、酸性のｐＨ下で伸展したコイルドコイルであることが、Ｃａｒｒ及びＫｉｍによって示された（Carr and Kim, 1993, Cell 73: 823-832）。]
[0101] 本発明の改変ポリペプチドは、一般に以下に提示されている式（Ｉ）、（ＩＩ）又は（ＩＩＩ）の構造を包含している。]
[0102] 本明細書に記載されている何れの改変ポリペプチドも、組成物（例えば、医薬組成物）又はキット中に存在させることができる。本発明のある態様では、組成物又はキットは、２つ又はそれ以上の改変ポリペプチドを含有している。例えば、組成物は、安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインを有している２つ又はそれ以上の改変ポリペプチドを含有することができる。]
[0103] 検討を明確にするために、本発明を、主にＨＩＶのＨＲ−１及びＨＲ−２改変ポリペプチドについて、更に記載する。しかしながら、エンベロープを持つもの及び持たないものの両方の、別のウィルス、並びに非ウィルス性生体に対して、この方式を類似方法で適用することができる。本明細書で用いられる用語「７アミノ酸繰り返し」はＨＲ−２及びＨＲ−１ペプチドを包含している。]
[0104] ＨＲ−２及びＨＲ−２−ペプチド
本発明の改変ポリペプチドは、ＨＩＶ−１由来のｇｐ１６０（配列番号１３）の６３８〜６７３及び６２６〜６６２のアミノ酸残基にそれぞれ対応し、それぞれ３６個及び３７個のアミノ酸配列を有するＨＲ−２ペプチド（配列番号１及び１３）を包含する。これをアミノからカルボキシ末端に読むと、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ（配列番号１）及び
ＭＴＷＭＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ（配列番号１３）である。]
[0105] 本発明で使用するためのその他の有用なＨＲ−２ポリペプチドは、米国特許第７，２７３，６１４号に記載されており、これはその全てを参照として本明細書に取り込まれている。]
[0106] 全長ＨＲ−２（配列番号１及び１３）の３６及び３７ｍｅｒ、及び対応する配列、並びにＨＩＶ−１株及び変異株の多様性に見出されるそれらの変異体の使用に加えて、本発明のペプチドは、ＨＲ−２（配列番号１及び１３）ペプチドの断片(truncation)、ＨＲ−２ドメインの側面に位置するｇｐ４１ポリペプチド配列（すなわち、直近上流又は下流配列）、又は抗融合（antifusogenic)活性及び抗ウィルス活性を示すキメラを含んでいてもよい。ＨＲ−２（配列番号１及び１３）ペプチドの断片は、図５及び６に示されているように、３〜３６個の間のアミノ酸残基のペプチドを含有することができる。この図のペプチド配列はアミノ末端（左）からカルボキシ末端（右）へ記載されている。]
[0107] 本発明の改変ポリペプチドはＨＲ−２様ペプチドも包含できる。本明細書で用いられる「ＨＲ−２様」又は「７アミノ酸繰り返し様」は、１個又はそれ以上のアミノ酸置換、挿入及び／又は欠失を含有している、全長の及び切断された並びにキメラのＨＲ−２ポリペプチドを、更にホモロジー検索によって同定又は確認されたペプチド配列も示す。代表的なＨＲ−２様ポリペプチドは、図５又は図６に説明されているようなものを包含する。本発明の改変ＨＲ−２様ポリペプチドは抗融合又は抗ウィルス活性を示すことができる。
一態様では、７アミノ酸繰り返しドメイン２は、図５、図６、配列番号１又は配列番号１３のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成する。また、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメイン２は、相互作用表面の残基が図５、図６、配列番号１又は配列番号１３のそれと同一であるか又はそれらの同類置換である限り、３０％又はそれ以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を同定する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0108] ＨＩＶ−１とＨＩＶ−２のエンベロープタンパク質は構造的に異なっているが、ＨＩＶ−１及びＨＩＶ−２のＨＲ−２領域内には著しいアミノ酸保存が存在している。このアミノ酸保存には周期的特性があって、構造及び／又は機能の幾つかの保存性を示唆している。従って、アミノ酸置換が考えられる種類は、本発明のＨＲ−２ペプチドの構造を安定化することが予測されるアミノ酸変更のようなものを包含するだろう。本明細書に記載されているＨＲ−２及びＨＲ−２類縁配列を用いて、当業者はＨＲ−２コンセンサス配列を容易に翻訳して、それから好ましいアミノ酸置換を示すことができる同類アミノ酸残基を確認することができる。]
[0109] アミノ酸置換は同類又は非同類特性があるものでよい。同類アミノ酸置換は、ＨＲ−２（配列番号１又は１３）ペプチド配列の１個又はそれ以上のアミノ酸を同じ荷電、大きさ、及び／又は疎水性特性のアミノ酸と置き換えることから成っていて、例えば、グルタミン酸（Ｅ）をアスパラギン酸（Ｄ）に、アスパラギン酸（Ｄ）をアスパラギン（Ｎ）に、そしてグルタミン酸（Ｅ）をグルタミン（Ｑ）にアミノ酸置換するようなことである。非同類置換は、ＨＲ−２ペプチド配列の１個又はそれ以上のアミノ酸を非類似の電荷、大きさ、及び／又は疎水性特性を有するアミノ酸で置換することから成っていて、例えば、グルタミン酸（Ｅ）をバリン（Ｖ）に置換するようなことである。]
[0110] アミノ酸挿入は、単一のアミノ酸残基又は一続きの残基から成っていてもよい。挿入は全長又は切断ＨＲ−２ペプチドのカルボキシ又はアミノ末端で、更にはペプチドの内部位置でも行うことができる。このような挿入は、通常長さが２〜１５アミノ酸の範囲である。目的のペプチドのカルボキシ又はアミノ酸末端の何れかで行われる挿入は、大きさの範囲をより広くするように意図され、約２〜約５０個のアミノ酸が好ましい。１個又はそれ以上のそのような挿入を、そのような挿入が抗融合又は抗ウイルス活性を示す改変ポリペプチドをもたらす限り、全長（配列番号１又は１３）又は切断ＨＲ−２ポリペプチドに導入することができる。]
[0111] 好ましいアミノ又はカルボキシ末端挿入は、それぞれ実際のＨＲ−２ｇｐ４１アミノ酸配列のアミノ末端又はカルボキシ末端の何れかであるｇｐ４１タンパク質領域に対応している、長さが約２〜約５０アミノ酸残基の範囲のペプチドである。従って、好ましいアミノ末端又はカルボキシ末端アミノ酸挿入は、ｇｐ４１タンパク質のＨＲ−１領域に対するアミノ又はカルボキシ末端に直接見られるｇｐ４１アミノ酸配列を含有することになる。]
[0112] 全長（配列番号１又は１３）又は切断ＨＲ−２ポリペプチドの欠失も本発明の範囲内である。このような欠失は、ＨＲ−２又はＨＲ−２様ペプチド配列から１個又はそれ以上のアミノ酸を除去することから成っていて、得られるペプチド配列の長さの下限は４〜６個のアミノ酸である。このような欠失は、ペプチド配列の単一連続しているか又は１個以上離れた部分に関わっていてよい。１個又はそれ以上のそのような欠失を、そのような欠失が未だに抗融合又は抗ウィルス活性を示すことができるペプチドをもたらす限り、全長（配列番号１又は１３）又は切断ＨＲ−２ポリペプチドに導入することができる。]
[0113] ＨＲ−１及びＨＲ−１ペプチド
更に、本発明の改変ペプチドは、ＨＲ−１類縁体に対応するアミノ酸配列を有しているペプチドを包含している。ＨＲ−１は、強力な抗ウィルス活性を示して、以下に示すような、ＨＩＶ−１膜貫通（ＴＭ）ｇｐ４１タンパク質のそれぞれ５５３〜５９０及び５４２〜５９２に対応する３８及び５１アミノ酸ペプチドを包含している。]
[0114] ＮＮＬＬＲＡＩＥＡＱＱＨＬＬＱＬＴＶＷＧＩＫＱＬＱＡＲＩＬＡＶＥＲＹＬＱＤＱ（配列番号２）又は
ＲＱＬＬＳＧＩＶＱＱＱＮＮＬＬＲＡＩＥＡＱＱＨＬＬＱＬＴＶＷＧＩＫＱＬＱＡＲＩＬＡＶＥＲＹＬＱＤＱＱＬ（配列番号１４）。]
[0115] ３８ｍｅｒの全長ＨＲ−１に加えて、本発明の改変ペプチドは、抗融合活性又は抗ウィルス活性を示す、ＨＲ−１ペプチドの切断部を包含している。ＨＲ−１ペプチドの切断部は、ＨＲ−２について図５及び図６に例示してあるものと同様な方法で作成することができる。]
[0116] 本発明の改変ペプチドはＨＲ−１様ペプチドも包含している。本明細書で用いられている「ＨＲ−１様」又は「７アミノ酸繰り返し様」は、１個又はそれ以上のアミノ酸置換、挿入及び／又は欠失を包含して、抗融合又は抗ウィルス活性を示す全長及び切断ＨＲ−１ポリペプチドを示す。
一態様では、７アミノ酸繰り返しドメイン１は、配列番号２、配列番号３又は配列番号１４のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成する。
また、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメイン１は、相互作用表面の残基が配列番号２、３又は１４のそれと同一であるか、又はそれらの同類置換である限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を同定する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0117] ＨＩＶ−１とＨＩＶ−２のエンベロープタンパク質は構造的に異なっているが、ＨＩＶ−１及びＨＩＶ２のＨＲ−１対応領域内には著しいアミノ酸保存が存在している。このアミノ酸保存には周期的特性があって、構造及び／又は機能の幾つかの保存性を示唆している。従って、アミノ酸置換が考えられる種類は、本発明のＨＲ−１ペプチドの構造を安定化することが予測されるアミノ酸変更のようなものを包含するだろう。本明細書に記載されているＨＲ−１及びＨＲ−１類縁配列を用いて、当業者はＨＲ−１コンセンサス配列を容易に翻訳して、それから好ましいアミノ酸置換を示すことができる同類アミノ酸残基を確認することができる。]
[0118] アミノ酸置換は同類又は非同類特性があるものでよい。同類アミノ酸置換は、ＨＲ−１ペプチド配列の１個又はそれ以上のアミノ酸を同じ荷電、大きさ、及び／又は疎水性特性のアミノ酸と置き換えることから成っていて、例えば、グルタミン酸（Ｅ）をアスパラギン酸（Ｄ）に、アスパラギン酸（Ｄ）をアスパラギン（Ｎ）に、そしてグルタミン酸（Ｅ）をグルタミン（Ｑ）にアミノ酸置換するようなことである。非同類置換は、ＨＲ−１ペプチド配列の１個又はそれ以上のアミノ酸を非類似の電荷、大きさ、及び／又は疎水性特性を有するアミノ酸で置換することから成っていて、例えば、グルタミン酸（Ｅ）をバリン（Ｖ）に置換するようなことである。]
[0119] アミノ酸挿入は単一のアミノ酸又は一続きの残基から成っていてもよい。挿入は全長又は切断ＨＲ−１ペプチドのカルボキシ又はアミノ末端で、更にはペプチドの内部位置でも行うことができる。このような挿入は通常長さが２〜１５アミノ酸の範囲である。目的のペプチドのカルボキシ又はアミノ酸末端の何れかで行われる挿入は、大きさの範囲をより広くするように意図され、約２〜約５０個のアミノ酸が好ましい。１個又はそれ以上のそのような挿入を、そのような挿入が抗融合又は抗ウイルス効果を示す改変ポリペプチドをもたらす限り、全長又は切断ＨＲ−１ポリペプチドに導入することができる。]
[0120] 好ましいアミノ又はカルボキシ末端挿入は、長さが約２〜約５０アミノ酸残基の範囲のペプチドであって、実際のＨＲ−１ｇｐ４１アミノ酸配列のそれぞれぞれアミノ末端又はカルボキシ末端の何れかであるｇｐ４１タンパク質領域に対応している。従って、好ましいアミノ末端又はカルボキシ末端アミノ酸挿入は、ｇｐ４１タンパク質のＨＲ−１領域のアミノ又はカルボキシ末端に直接見られるｇｐ４１アミノ酸配列を含有することになる。]
[0121] 全長又は切断ＨＲ−１ポリペプチドの欠失も本発明の範囲内である。このような欠失はＨＲ−１又はＨＲ−１様ペプチド配列から１個又はそれ以上のアミノ酸を除去することから成り、得られるペプチド配列の最低限の長さは４〜６個のアミノ酸である。このような欠失は、ペプチド配列の１個近接しているか又は１個以上離れている位置に関わっていてよい。１個又はそれ以上の欠失を、そのような欠失が未だに抗融合又は抗ウィルス活性を示しているペプチドをもたらす限り、全長又は切断ＨＲ−１ポリペプチドに導入することができる。]
[0122] ＨＲ−１及びＨＲ−２類縁体
全長及び切断ＨＲ−１及びＨＲ−２ポリペプチドの類縁体に対応する、上記のペプチドは、その他のウィルスにも見出すことができる。本明細書で用いられる用語「ＨＲ−１及びＨＲ−２類縁体」は、非ＨＩＶウィルス中の７アミノ酸繰り返し類縁ドメインを有していると確認又は同定されたペプチドを示す。７アミノ酸繰り返し類縁ポリペプチドを同定する方法は、当該技術分野で公知であり、例えば、タンパク質配列からのコイルドコイルを認識してそれらの構造をモデル化する能力を有している、残基対の相関に基づく生物情報プログラム（例えば、:ch.embnet.org/software/COILS_form.htlmのワールドワイドウェブ上）である（参照して本明細書に取り込まれている、Lupas, A., et al. Science 1991. 252(5009): p. 1162-1164 を参照されたい）。更に、このような改変ペプチドは抗融合又は抗ウィルス活性を示してもよい。]
[0123] このようなＨＲ−２及びＨＲ−１類縁体は、例えば、その他のエンベロープウィルスの膜貫通タンパク質に存在するペプチド配列に対応していいてよい。このようなペプチドは抗融合又は抗ウィルス活性を示す。]
[0124] ＨＲ−２類縁体は、例えば、それからＨＲ−２（配列番号１）が得られたｇｐ４１ペプチド領域に対応している別のウィルスのペプチド領域のアミノ酸配列から成っている。このようなウィルスは、これに限定されないが、別のＨＩＶ−１単離株、ＨＩＶ−２単離株、ＳＩＶ単離株、インフルエンザ、パラインフルエンザウィルス、コロナウィルス、ＲＳＶ、等を包含できる。]
[0125] ＨＲ−１類縁体は、例えば、それからＨＲ−１（配列番号２）が得られたｇｐ４１ペプチド領域に対応している別のウィルスのペプチド領域のアミノ酸配列から成っている。このようなウィルスは、これに限定されないが、別のＨＩＶ−１単離株、ＨＩＶ−２単離株、ＳＩＶ単離株、パラインフルエンザウィルス、コロナウィルス、ＲＳＶ、等を包含できる。]
[0126] ＨＲ−１及びＨＲ−２類縁体又はその他の７アミノ酸繰り返しポリペプチドは、そのアミノ酸配列が、例えばそれからＨＲ−１（配列番号２又は配列番号３）及びＨＲ−２（配列番号１）が得られたｇｐ４１ペプチド領域に対応しているその他のウィルスのペプチド領域のアミノ酸配列から成っている。これらのポリペプチドは次のものを包含する。]
[0127] （配列番号４）、（配列番号５）、（配列番号１１）、又は（配列番号１２）と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成するＲＳＶ７アミノ酸繰り返しドメイン。]
[0128] （配列番号６）と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成するパラインフルエンザウィルス７アミノ酸繰り返しドメイン。]
[0129] （配列番号７）、又は（配列番号８）と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成するコロナウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメイン。]
[0130] （配列番号９）、又は（配列番号１０）と３０％又はそれ以上同一であって、αらせんを形成するフィロウィルスαらせん７アミノ酸繰り返しドメイン。]
[0131] 本発明の改変ポリペプチドは、インフルエンザウィルス７アミノ酸繰り返しドメインの使用も意図している。]
[0132] また、改変ポリペプチドの７アミノ酸繰り返しドメインは、相互作用表面の残基が参照配列の相互作用表面のそれと同一であるか、又はそれらの同類置換である限り、３０％以上異なっていてもよい。７アミノ酸繰り返しの相互作用表面残基を同定する方法は、当該技術分野で周知であって、本明細書に記載されている。]
[0133] ７アミノ酸繰り返し体又は７アミノ酸繰り返し類縁体は、例えば、当該技術分野で公知のコンピュータ支援検索戦略を用いて確認又は同定される。例えば、タンパク質配列からのコイルドコイルを認識してそれらの構造をモデル化する能力を有している、残基対の相関に基づく生物情報プログラム（例えば、:ch.embnet.org/software/COILS_form.htlmのワールドワイドウェブ上）（両者の全てを参照して本明細書に取り込まれている、Lupas, A., et al. Science 1991. 252(5009): p. 1162-1164 及び米国特許第７，２７３，６１４号を参照されたい）。検索戦略はＨＲ−１及び／又はＨＲ−２のそれと類似の構造及び／又はアミノ酸配列特性を有することが予測される更なるペプチド領域を同定できる。]
[0134] ７アミノ酸繰り返しポリペプチドの安定化
本発明の改変ポリペプチドは安定化された（例えば、架橋された）αらせんドメインを有している。ポリペプチドが炭化水素架橋されていることが好ましい。炭化水素架橋は米国特許出願公開第２００５／０２５０６８０号に記載されていて、これはその全てを参照して本明細書に取り込まれている。]
[0135] ペプチドαらせんは、比較的大きい接触表面領域に渡って規則正しく正確に配列されている特定のアミノ酸残基の存在によって、非常に重要なタンパク質相互作用に寄与している（Chittenden, T., et al., Embo Journal, 1995. 14(22): p. 5589-5596; Kussie, P.H., et al. Science, 1996. 274(2589): p. 948-953; Ellenberger, T.E. et al., Cell, 1992.71(7): p. 1223-1237）。αらせんドメインは、タンパク質の残余部分にある骨格配列によって安定化されることが多く、これはαらせん構造の前形成を促進する。文脈を無視して解釈すると、αらせんペプチドのモチーフを展開して生物活性の損失に至らせることができる。重大な挑戦は、それらの元来のαらせん構造を保持していることを含むαらせんペプチドを開発すること、及びタンパク分解、酸及び熱分解に抵抗でき、それによってインビボで原形を保てるペプチドを製造することである。]
[0136] 炭化水素架橋は、少なくとも二つのアミノ酸を介してポリペプチドを安定に架橋するための過程を示し、これはそのポリペプチドの元来の二次構造を構造的にもたらすのに役立つ。炭化水素架橋は、ポリペプチドを、αらせん二次構造を有して、その元来のαらせん配置を保持しやすくする。この二次構造は、タンパク分解開裂及び熱に対するポリペプチドの耐性を増大し、そして疎水性も増大することができる。従って、本明細書に記載されている炭化水素架橋された（架橋）ポリペプチドは、対応する炭化水素架橋されていない（非架橋）ポリペプチドと比較して改善された生物活性を有している。例えば、架橋ポリペプチドはＨＩＶポリペプチドのαらせんドメイン（例えば、ＨＲ−１／ＨＲ−２ドメイン）を含有することができ、これはＨＩＶの細胞との接着、融合及び細胞の感染を妨げる。ある場合には、架橋ポリペプチドを、ウィルスの細胞への侵入を阻害するために用いることができる。本明細書に記載されている架橋ポリペプチドは、治療的に、例えばＨＩＶを処置するために、用いることができる。]
[0137] 炭化水素架橋ポリペプチドは２個のアミノ酸の間の鎖（連鎖）を包含し、この鎖はポリペプチドのαらせん二次構造を有意に増強する。一般に、鎖は１つ又は２つのらせん回転の長さ（すなわち、約３．４又は約７アミノ酸）にわたっている。
従って、ｉ及びｉ＋３；ｉ及びｉ＋４；又はｉ及びｉ＋７に位置するアミノ酸が、化学修飾及び架橋のための理想的な候補である。
従って、例えば、ペプチドが配列．．．Ｘ１、Ｘ２、Ｘ３、Ｘ４、Ｘ５、Ｘ６、Ｘ７、Ｘ８、Ｘ９．．．を有している場合には、Ｘ１とＸ４の間、又はＸ１とＸ５の間、又はＸ１とＸ８の間の架橋は、Ｘ２とＸ５の間、Ｘ２とＸ６間、又はＸ２とＸ９の間等の架橋と同様に有用である。]
[0138] 複数の架橋（例えば、２、３、４又はそれ以上）の使用も、個々の架橋付加物の利点を結び付けて達成されており（例えば、改善されたらせん性と活性；改善されたらせん性と熱安定性；改善されたらせん性と酸安定性）。
従って、本発明は、配列を更に安定化するために、或いはより長いポリペプチド伸長の構造安定性、タンパク分解耐性、熱安定性、酸安定性、及び生物活性増強を促進するためにポリペプチド配列内への一つ又はそれ以上の架橋の取り込みを包含する。]
[0139] 一態様では、本発明の改変ポリペプチドは式（Ｉ）を有する。]
[0140] ]
[0141] 式中の、Ｒ１及びＲ２は、独立してＨ又はＣ１〜Ｃ１０のアルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、又はヘテロシクリルアルキルである。
Ｒ３は、アルキル、アルケニル、アルキニル、又は［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎであり、これらはそれぞれ０〜６個のＲ５で置換されている。
Ｒ４は、アルキル、アルケニル、又はアルキニルである。
Ｒ５は、ハロ、アルキル、ＯＲ６、Ｎ（Ｒ６）２、ＳＲ６、ＳＯＲ６、ＳＯ２Ｒ６、ＣＯ２Ｒ６、Ｒ６、蛍光部分、又は放射性同位元素である。
ＫはＯ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、ＣＯＮＲ６、又は]
[0142] ]
[0143] である。
Ｒ６は、Ｈ、アルキル、又は治療薬剤である。
ｎは、１〜４の整数である。
ｘは、２〜１０の整数である。
それぞれのｙは、独立して０〜１００の整数である。
ｚは、１〜１０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０）である。
そしてそれぞれのＸａａは、独立してアミノ酸である。]
[0144] 改変ポリペプチドはαらせんを形成して、配列番号１〜１４、図５、図６、]
[0145] ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又は
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ]
[0146] のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を包含する。
式中の、Ｘは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである。]
[0147] この鎖は、アルキル、アルケニル、又はアルキニル部分（例えば、Ｃ５、Ｃ８又はＣ１１アルキル又はＣ５、Ｃ８又はＣ１１アルケニル、又はＣ５、Ｃ８又はＣ１１アルキニル）を包含できる。結合したアミノ酸はα−ジ置換（例えば、Ｃ１〜Ｃ３又はメチル）であってよい。]
[0148] ある場合は、ｘが２、３、又は６である。
ある場合は、それぞれのｙが独立して３と１５の間の整数である。
ある場合は、それぞれのｙが独立して１と１５の間の整数である。
ある場合は、Ｒ１及びＲ２がそれぞれ独立してＨ又はＣ１〜Ｃ６アルキルである。
ある場合は、Ｒ１及びＲ２がそれぞれ独立してＣ１〜Ｃ６アルキルである。
ある場合は、Ｒ１及びＲ２の少なくとも一方がメチルである。例えば、Ｒ１及びＲ２の両方がメチルである。]
[0149] ある場合は、Ｒ３がアルキル（例えば、Ｃ８アルキル）であって、ｘが３である。
ある場合は、Ｒ３がＣ１１アルキルであって、ｘが６である。
ある場合は、Ｒ３がアルケニル（例えば、Ｃ８アルケニル）であって、ｘが３である。
ある場合は、ｘが６であって、Ｒ３がＣ１１アルケニルである。
ある場合は、Ｒ３が直鎖のアルキル、アルケニル、又はアルキニルである。
ある場合は、Ｒ３が、−−ＣＨ２−−ＣＨ２−−ＣＨ２−−ＣＨ＝ＣＨ−−ＣＨ２−−ＣＨ２−−ＣＨ２−− である。]
[0150] ある特定の態様では、２つのα、αジ置換立体中心の両方がＲ配座又はＳ配座（例えば、ｉ、ｉ＋４架橋）にあるか、又は一方の立体中心がＲで他方がＳ（例えば、ｉ、ｉ＋７架橋）にある。従って、式Ｉが]
[0151] ]
[0152] のように表される場合は、例えばＸが３であるとき、Ｃ’及びＣ”ジ置換立体中心は両方がＲ配座にあるか又はそれらの両方がＳ配座にあることができる。Ｘが６のときは、Ｃ’ジ置換立体中心がＲ配座にあって、Ｃ”ジ置換立体中心はＳ配座にある。Ｒ３二重結合はＥ又はＺの立体化学配座であってよい。]
[0153] ある場合は、Ｒ３が［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎであって、Ｒ４が直鎖のアルキル、アルケニル、又はアルキニルである。]
[0154] ある態様では、改変ポリペプチドは、７アミノ酸繰り返し又は７アミノ酸繰り返し様ドメイン、例えば、ＨＩＶ−１のＨＲ−１又はＨＲ−２ドメインの、少なくとも３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、２７個、２８個、２９個、３０個、３１個、３２個、３３個、３４個、３５個、３６個、３７個、３８個、３９個、４０個、４５個、５０個、又はそれ以上の連続したアミノ酸を含有している。
それぞれの［Ｘａａ］ｙは、独立して７アミノ酸繰り返し又は７アミノ酸繰り返し様ドメイン、例えば、ＨＩＶ−１のＨＲ−１又はＨＲ−２ドメインの、少なくとも５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２５個、又はそれ以上の連続したアミノ酸を含有していてよいペプチド、例えば、図５及び６の何れかで表されているポリペプチドである。
［Ｘａａ］ｘは、７アミノ酸繰り返し又は７アミノ酸繰り返し様ドメイン、例えば、ＨＩＶ−１のＨＲ−１ドメイン又はＨＲ−２ドメインの酸の、３個又は６個の連続したアミノ酸を含有していてよいペプチド、例えば、配列番号１〜１４又は図５又は６のアミノ酸配列を有するポリペプチドである。]
[0155] 改変ポリペプチドは、７アミノ酸繰り返し又は７アミノ酸繰り返し様ドメイン、例えば、ＨＩＶ−１のＨＲ−１又はＨＲ−２ドメインの酸の、３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２５個、３０個、３５個、４０個、４５個、５０個の連続したアミノ酸を含有してよく、例えば、配列番号１〜１４又は図５又は６のアミノ酸配列を有するポリペプチドである。ここでは、２個、３個、又は６個のアミノ酸で隔てられている２個のアミノ酸が、Ｒ３を介して結合しているアミノ酸置換によって置き換わっている。従って、少なくとも２つのアミノ酸を、連結アミノ酸又は連結アミノ酸置換で置き換えることができる。従って、式（Ｉ）を]
[0156] ]
[0157] で表した場合は、［Ｘａａ］ｙ’及び［Ｘａａ］ｙ”はそれぞれ、同一又は異なった７アミノ酸繰り返し又は７アミノ酸繰り返し様ドメイン由来の連続したポリペプチド配列を含有していてよい。]
[0158] 本発明は、７アミノ酸繰り返し又は７アミノ酸繰り返し様ドメイン、例えば、ＨＩＶ−１のＨＲ−１又はＨＲ−２ドメインの１０個（１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、３０個、３５個、４０個、４５個、５０個、又はそれ以上）連続したアミノ酸を含有する架橋ポリペプチド、例えば、配列番号１〜１４又は図５又は６のアミノ酸配列を有するポリペプチドを特徴としている。ここでは、２個、３個、又は６個のアミノ酸で隔てられている２個のアミノ酸のα−炭素がＲ３を介して結合しており、２つのα−炭素の一方がＲ１で置換されていて、他方がＲ２で置換されており、そしてそれぞれがペプチド結合を介して更なるアミノ酸と結合している。]
[0159] 別の態様では、本発明の改変ポリペプチドは式（ＩＩ）を有している。]
[0160] ]
[0161] 式中の、それぞれのＲ１及びＲ２は独立して、Ｈ，アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、又はヘテロシクリルアルキルである。
それぞれのｎは、独立して１〜１５の整数である。
ｘは、２、３、又は６である。
それぞれのｙは、独立して０〜１００の整数である。
ｚは、１〜１０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０）である。
それぞれのＸａａは、独立してアミノ酸である。]
[0162] 改変ポリペプチドは、αらせんを形成して、配列番号１〜１４、図５又は図６のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一のアミノ酸配列を有することができるか、又は改変ポリペプチドは、配列：]
[0163] ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又は
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ：]
[0164] を有する７アミノ酸繰り返しドメインを含有している。式中の、Ｘは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである。]
[0165] 更に別の態様では、本発明の改変ポリペプチドは式（ＩＩＩ）を有している。]
[0166] ]
[0167] 式中の、Ｒ１及びＲ２は、それぞれの独立してＨ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、又はヘテロシクリルアルキルである。
Ｒ３は、アルキル、アルケニル、アルキニル、［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎ、又は天然アミノ酸の側鎖であって、これらのそれぞれは０〜６個のＲ５で置換されている。
Ｒ４は、アルキル、アルケニル、又はアルキニルである。
Ｒ５は、ハロ、アルキル、ＯＲ６、Ｎ（Ｒ６）２、ＳＲ６、ＳＯＲ６、ＳＯ２Ｒ６、ＣＯ２Ｒ６、Ｒ６、蛍光部分、又は放射性同位元素である。
Ｋは、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、ＣＯＮＲ６、又は]
[0168] ]
[0169] である。
Ｒ６は、Ｈ、アルキル、又は治療薬剤である。
Ｒ７は、アルキル、アルケニル、アルキニル、［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎ、又は天然アミノ酸の側鎖であって、これらのそれぞれは０〜６個のＲ５で置換されている。
ｎは、１〜４の整数である。
ｘは、２〜１０の整数である。
それぞれのｙは、独立して０〜１００の整数である。
ｚは、１〜１０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０）である。
それぞれのＸａａは、独立してアミノ酸である。]
[0170] ポリペプチドはαらせんを形成して、配列番号１〜１４、図５、図６のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一のアミノ酸配列を含有するか、又は改変ポリペプチドは、配列：]
[0171] ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又は
ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ：]
[0172] を有する７アミノ酸繰り返しドメインを含有している。式中の、Ｘは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである。]
[0173] 炭化水素鎖は記載されているが、その他の鎖も想定される。例えば、鎖は１個又はそれ以上のエーテル、チオエーテル、エステル、アミン、又はアミド部分を包含できる。ある場合は、天然アミノ酸の側鎖を鎖の中に組み込むことができる。例えば、鎖を、セリン中のヒドロキシル、システイン中のチオール、リジン中の１級アミン、アスパラギン酸又はグルタミン酸中の酸、又はアスパラギン又はグルタミン中のアミドのような、官能基と結合することができる。従って、２つの非天然アミノ酸を結合して作った鎖を用いる以外にも天然のアミノ酸を用いて鎖を作ることができる。単一の非天然アミノ酸を天然のアミノ酸と共に用いることもできる。]
[0174] 鎖の長さを変えることも更に想定される。例えば、二次αらせん構造に比較的高度の拘束を与えることが好ましいときに、長さがより短い鎖を用いることができるのに対して、二次αらせん構造に低い拘束を与えることが望ましい様な場合には、より長い鎖が望ましい。]
[0175] 更に、主にαらせんの単一表面に鎖を提供するために、アミノ酸ｉからｉ＋３、ｉからｉ＋４、及びｉからｉ＋７にまたがる鎖の例が記載されているが、アミノ酸の数の何れの組み合わせにもまたがるように鎖を合成することができる。]
[0176] 当業者に評価されるように、本明細書に記載されている化合物を合成する方法は当業者にとって明瞭であろう。従って、所望の化合物を得るために、代替えの配列又は順序で多くの合成工程を実施することができる。本明細書に記載されている化合物を合成するのに有用な、合成化学変換及び保護基手順（保護及び脱保護）は当該技術分野で公知であって、例えば、R. Larock, Comprehensive Organic Transformation,VCH Publishers (1989); T. W. Greene and P. G. M. Wuts, Protective Groups in Organic Syntesis, 2d. Ed., John Wiley and Sons (1991); L. Fieser and M. Fieser, Fieser and Fieser's Reagent for Organic Synthesis, John Wiley and Sons (1994); 及び L. Paquette, ed., Encyclopedia of Reagents for Organic Syntesis, John Wiley and Sons (1995) 及びこれらの続版に記載されているようなものを含む。]
[0177] ペプチドの合成
本発明のペプチドは化学合成方法によって作成することができ、これは当業者にとって周知であって、本明細書に記載されている。例えば、Fieldset al., Chapter 3 in Syntehtic Peptides: A User's Guide, ed. Grant, W. H. Freeman & Co. New York, N.Y., 1992, p. 77 を参照されたい。従って、例えば、Applied Biosystems Peptide Synthesizer Model 430A 又は 431 或いは AAPPTEC multichannel synthesizer APEX 396 上で、側鎖保護アミノ酸を用いて、ｔ−Ｂｏｃ又はＦ−ｍｏｃ化学の何れかで保護したα−ＮＨ２で、ペプチドを固相合成の自動 Merrifield 技術を用いて合成することができる。]
[0178] 本明細書に記載されているペプチドを作成する１つの方法は、固相ペプチド合成（ＳＰＰＳ）を用いることである。Ｃ−末端アミノ酸を、架橋ポリスチレン樹脂に、リンカー分子との酸に不安定な結合を介して接着する。この樹脂は合成に用いる溶媒に不溶性であって、過剰の試薬及び副産物を比較的単純かつ迅速に洗い流す。Ｎ末端を、酸に安定であるが、塩基で除去可能な、Ｆｍｏｃ基で保護する。何れの側鎖官能基も塩基に安定で酸に不安定な基で保護する。]
[0179] より長いペプチドは、個々の合成ペプチドを天然の化学ライゲーションを用いて対等接続させることによって作成できる。また、より長い合成ペプチドは、周知の遺伝子組み換えＤＮＡ技術によって合成できる。このような技術は、周知の標準的なマニュアルに詳細な手順と共に載っている。本発明のペプチドをコードする遺伝子を構築するために、好ましくは、遺伝子が発現される生体に最適なコドンを用いて、アミノ酸配列を逆翻訳してそのアミノ酸配列をコードする核酸配列を得る。次に、通常、ペプチドをコードするオリゴヌクレオチド、及び所望により、何れかの調節エレメントを合成して、合成遺伝子を作成する。合成遺伝子を適当なクローニングベクターに挿入して、宿主細胞にトランスフェクトする。更に、炭化水素架橋のために非天然アミノ酸を組み込めるように宿主細胞を改変する。次いで、選択した発現系及び宿主に適している条件下で、ペプチドが発現する。Liu et al., Proc. Nat. Acad. Sci (USA), 94:10092-10097 (1997) を参照されたい。ペプチドを標準的な方法で精製して特性化する。]
[0180] ペプチドを、高性能、コンビナトリアル方法で、例えば、Advanced Chemtech から入手できる、高性能多チャンネルコンビナトリアルシンセサイザーを用いて作成することができる。]
[0181] 抗ウィルス活性のアッセイ
本発明のペプチドのような、化合物の、インビトロ及びインビボの両方で膜融合を阻害しそして／又は抗ウィルス活性を示す能力を評価する方法が本明細書に記載されている。特にこのようなアッセイは以下にそして実施例４及び５に記載されている。抗ウィルス活性を評価するための更なるアッセイは当業者に周知である。]
[0182] 本発明のペプチドによって示される抗ウィルス活性は、例えば、本明細書に記載されていて、当業者に公知のもののような、インビトロアッセイを容易に実施して測定することができる。これは、合胞体形成を阻害するペプチドの能力、又は無細胞ウィルスによる感染を阻害するそれらの能力を試験できる（Madani, N., et al., Journal of Virology, 2007. 81(2): p. 532-538; Si, Z.H., M. Cayabyab, and J. Sodroski, Journal of Virology, 2001. 75(9): p. 4208-4218; Si, Z.H., et al., PNAS USA, 2004. 101(14): p. 5036-5041）。]
[0183] これらのアッセイを用いて、ウィルスの所定株に対して示すペプチドの相対的な抗ウィルス活性及び／又はペプチドの株特異的阻害活性を測定することができる。]
[0184] ペプチドの抗ウィルス能力を試験するアッセイは本発明の意図するところである。１例としてＨＩＶを取り上げると、逆転写酵素（ＲＴ）アッセイが、無細胞ＨＩＶによるＣＤ−４＋細胞の感染を阻害するペプチドの能力を試験するために利用される。このようなアッセイは、試験されるペプチドの存在下で適切な濃度（すなわち、５０％組織培養感染量(Tissue Culture Infection Dose 50)）のウィルスとＣＤ−４＋細胞を培養することを含むことができる。当業者に周知の培養条件が用いられる。ペプチドを添加していないコントロール培養に加えて、様々なペプチド濃度が用いられる。適切な期間（例えば７日間）培養物を培養した後、標準的な手法を用いて無細胞上澄液を調製して、成功した感染の測定として、ＲＴ活性の存在について試験する。ＲＴ活性は、例えば、Goff et al. (Goff, S. et al., 1981, J. Virol. 38:239-248) 及び／又は Willey et al. (Willey, R. et al., 1988, J. Virol. 62:139-147) に記載されているような、標準的な技術を用いて試験することができる。これらの引例はその全てが参照として本明細書に取り込まれている。]
[0185] 当業者に周知である標準的な方法を、非レトロウィルス活性をアッセイするために利用することができる。呼吸器合胞体ウィルス及びパラインフルエンザウィルス活性のアッセイ技術を検討するために、例えば、Pringle et al. (Pringle, C.R. et al., 1985, J. Medical Virology 17:377-386) を参照されたい。更に、このような技術の一般的な概説について、例えば、"Zinsser Microbiology", 1988, Joklik, W.K. et al., eds., Appleton & Lange, Norwalk, Conn., 19th ed., を参照されたい。これらの文献はその全てを参照して本明細書に取り込まれている。]
[0186] エンフュービルタイドによる初期治療に反応を示すＨＩＶ陽性患者が、通常最大８０週間以内に生じるウィルスのリバウンドを最終的に発現するということが知られている。エンフュービルタイドに対する耐性は、ｇｐ４１のＨＲ−１ドメイン内の突然変異に由来しているが、幾つかの遺伝子変化がＨＲ−２ドメインにも見出される（Xu, L., et al., Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2005. 49(3): p. 1113-1119; Perez-Alvarez, L., et al., Journal of Medical Virology, 2006. 78(2): p. 141-147）。Ｉ３７Ｖ、Ｖ３８Ａ／Ｅ／Ｍ、Ｑ３９Ｒ、Ｑ４０Ｈ、Ｎ４２Ｔ／Ｑ／Ｈ、Ｎ４３Ｄ／Ｑのような、これらの突然変異は、エンフュービルタイドを経験した患者にだけ見出される（Proveda, E., et al., Journal of Medical Virology, 2004. 74(1): p. 21-28; Melby, T., et al., AidsResearch and Human Retroviruses, 2006. 22(5): p. 375-385; Sista, P.R., et al., Aids 2004. 18(13): p. 1787-1794; Wei, X.P., et al., Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2002. 46(6): p. 1896-1905）。]
[0187] 本発明の改変ポリペプチドを、これらのエンフュービルタイド耐性ＨＩＶ株を阻害できるように作成できる。改変ポリペプチドのこれらのエンフュービルタイド耐性ＨＩＶ株を処置する能力を評価する１つの好ましい方法は、Root, M.J., M.S. Kay, and P.S. Kim, Science, 2001.291(5505): p. 884-888 に記載されているような、５へリックスバンドルアッセイ（five-helix bundle assay）である。]
[0188] つまり、５へリックスバンドルアッセイには、耐性突然変異を組み込んでいるポリペプチドが含まれる。次いで、ＦＩＴＣ標識ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物をこれらの突然変異５へリックスバンドルタンパク質に対してスクリーニングして、何れかの天然ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物が、ＨＲドメインの突然変異にも関わらず活性を保持しているかどうかを確認することができる。ＦＩＴＣ標識突然変異ＳＡＨ−ｇｐ４１（ｍＳＡＨ−ｇｐ４１）化合物を、突然変異５へリックスバンドルタンパク質に対する結合親和性について及び１次耐性株を用いるＨＩＶ感染性の抑制についてスクリーニングすることができる。]
[0189] 別の態様では、本発明の改変ポリペプチドを、ＨＩＶ単離株における耐性の発生をモニターするために用いることができる。ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物に対する潜在的な耐性を探索するために、ＨＩＶ株を細胞培養中で次第に増大する濃度のリード(lead)ＳＡＨ−ｇｐ４１化合物の存在下に培養することができる。耐性の発現をモニターするために耐性株の遺伝子型を同定できる（Dwyer et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 104:12772 (2007) を参照されたい）。本発明の１つのポリペプチドに対する耐性は、別の変異体に対する感受性に影響を及ぼさないが（Ray, N., et al., Journal of Virology, 2007. 81(7): p. 3240-3250）、治療は、ＨＩＶの耐性株を処置することのできる異なったＳＡＨ−ｇｐ４１ポリペプチドの組み合わせを包含していてもよいことを意図している。]
[0190] 例えば、本発明のペプチドの抗ウィルス活性を試験するために、インビボアッセイも利用できる。抗ＨＩＶ活性を試験するために、例えば、Barnett et al.(Barnett, S.W. et al., 1994, Science 266:642-646）に記載されているインビボモデルを用いることができる。]
[0191] また、抗ＲＳＶ活性を、ＲＳＶプラークアッセイを用いてインビトロで、そして周知のマウスモデル（Kong et al., Virology J. 2(1):3 (2005)）によってインビボで試験することができる。例えば、ＲＳＶを各種同系交配のマウスに鼻腔内投与することができる。全ての系統の肺にウィルスが複製するが、Ｐ／Ｎ、Ｃ５７Ｌ／Ｎ及びＤＢＡ／２Ｎマウスにおいて最も高い力価が得られる。ＢＡＬＢ／ｃマウスの感染は、リンパ球浸潤及び肺組織１ｇ当たり１０４〜１０５ｐｆｕの肺ウィルス力価を特徴とする無症候性細気管支炎を生じる（Taylor, G. et al., 1984, Infect. Immun. 43:649-655）。ＲＳＶのコットンラットモデルもよく知られている。コットンラットの鼻及び肺に高力価でウィルスが複製するが、炎症の徴候はあってもごく少ない。改変ウィルス性ポリペプチドの有効性を評価する更なるアッセイは当業者に周知である。]
[0192] 医薬組成物及び投与経路
本明細書で用いられているような、本発明の化合物（例えば、本明細書に記載されている改変ポリペプチド）は、それらの薬学的に許容される誘導体又はプロドラッグを包含するように定義される。「薬学的に許容される誘導体又はプロドラッグ」は、服用者に投与すると本発明の化合物を（直接又は間接的に）もたらすことができる、本発明の化合物の薬学的に許容される塩、エステル、エステルの塩、又はその他の誘導体の何れかを意味する。特に好適な誘導体及びプロドラッグは、そのような化合物を哺乳動物に投与したときに本発明の化合物のバイオアベイラビリティーを増大するもの（例えば、経口投与された化合物をより容易に血中に吸収できるようにすることにより）又は親種に比べて親化合物の生体部分（例えば、脳又はリンパ系）への送達を増強するようなものである。好ましいプロドラッグは、水溶性又は消化管の膜を通過する能動輸送を増大する基が本明細書に記載されている式の構造に付加されている誘導体を包含する。]
[0193] 本発明の化合物を、選択的な生物的特性を増強する適切な機能を付加して、改変することができる。このような改変は、当該技術分野で公知であって、所定の生体部分（例えば、血液、リンパ系、中枢神経系）への生物的侵入を増大する、経口アベラビリティーを増大するもの、注射による投与を可能にするために溶解性を増大するもの、代謝を変えるもの、及び排泄速度を変えるようなものを包含する。
本発明の化合物の薬学的に許容される塩は、薬学的に許容される無機及び有機の酸及び塩基に由来するようなものを包含する。適切な酸塩の例は、酢酸塩、アジピン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、酪酸塩、クエン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシルスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グリコール酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、２−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、パルミチン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、サリチル酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、トシル酸塩及びウンデカン酸塩を包含する。適切な塩基に由来する塩は、アルカリ金属（例えば、ナトリウム）、アルカリ土類金属（例えば、マグネシウム）、アンモニウム、及びＮ−（アルキル）４＋塩を包含する。本発明は本明細書に開示されている化合物の何れかの塩基性窒素含有基の４級化も想定している。そのような４級化によって水溶性又は油溶性又は分散性産物を得ることができる。]
[0194] 本発明の化合物を、例えば、体重１ｋｇ当たり約０．００１〜約１００ｍｇ、又は特定の薬剤の要件に従って、そしてより好ましくは体重１ｋｇ当たり０．５〜１０ｍｇの範囲の用量で、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内、筋肉内、又は皮下的注射で；又は経口で、頬側に、鼻腔内に、経粘膜で、膣内に、頸部に、局所に、眼科製剤で又は吸入によって投与することができる。本明細書の方法は望ましい又は所定の効果を達成する化合物又は化合物組成の有効量の投与を意図している。
通常、本発明の医薬組成物は、１日当たり約１〜約６回投与するか、或いはまた、連続注入として、又は例えば、膣内発泡剤として、又は単独で又は避妊薬と組み合わせて用いる場合に子宮頸部リング用に製剤化して投与する。このような投与は慢性又は急性治療として用いられてもよい。
単一剤形を調製するために担体物質と組み合わせることができる活性成分の量は、治療する宿主及び投与の特有な方法に基づいて変化する。典型的な製剤は約１％（ｗ／ｗ）〜約９５％の活性化合物を含有している。あるいは、そのような製剤は約２０％〜約８０％の活性化合物を含有している。]
[0195] 上で述べたより低い或いは高い用量も必要とされてもよい。特定の患者に対する特定な用量及び治療計画は、用いられる特定化合物の活性、年齢、体重、一般的な健康状態、性、食事、投与回数、排泄速度、薬剤の組み合わせ、疾患、状態及び症状の重症度及び経過、疾患、状態及び症状に対する患者の体内動態、及び治療医師の判断を含む、多種の因子によって決まる。]
[0196] 患者の状態が改善又は感染が予防されると、所望により、本発明の化合物、組成物又は組み合わせの維持用量を投与してもよい。続いて、投与の用量又は回数、或いはその両方を、症状に応じて、改善された症状を維持するレベルまで減らすことができる。しかしながら、患者は、病状の再発（例えば、ＨＩＶのウィルス負荷の増大）のために長期に渡る間欠投与を必要とすることができる。]
[0197] 本発明の医薬組成物は、本発明の化合物又はそれらの薬学的に許容される塩；例えばモルフィン又はコデインを含む、追加薬剤；及び薬学的に許容される担体、アジュバント又は賦形剤を含有している。本発明の別の組成物は、本発明の化合物又はそれらの薬学的に許容される塩；及び薬学的に許容される担体、アジュバント又は賦形剤を含有している。本明細書で説明されている組成物は、本明細書で説明されている化合物、更にもしあるなら追加の治療薬剤の、ＨＩＶ介在疾患又はその症状を含む、疾患又は病状の変調をもたらすのに有効な量を包含している。]
[0198] 用語「薬学的に許容される担体又はアジュバント」は、本発明の化合物と共に患者に投与されて、それらの薬理学的活性を損なわず、そして化合物の治療量を送達するのに十分な量を投与しても非毒性である、担体又はアジュバントを示す。]
[0199] 本発明の医薬組成物中で用いることができる薬学的に許容される担体、アジュバント及び賦形剤は、これに限定されないが、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、ｄ−α−トコフェロールポリエチレングリコール１０００コハク酸エステルのような自己乳化型薬物送達システム（ＳＥＤＤＳ）、Ｔｗｅｅｎ（登録商標）又はその他の同様な重合送達マトリックスのような医薬剤形で用いられる界面活性剤、ヒト血清アルブミンのような血清タンパク質、リン酸塩のような緩衝物質、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウム、飽和植物脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩又は電解質、例えば、硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、セルロースよりなる物質、ポリエチレングリコール、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリレート、ワックス、ポリエチレン−ポリオキシプロピレン−ブロック重合体、ポリエチレングリコール及び羊毛脂を包含する。α−、β−、及びγ−シクロデキストリンのようなシクロデキストリンも、本明細書に記載されている式の化合物の送達を増強するために有利に用いられる。]
[0200] 本発明の医薬組成物は経腸的に、例えば、経口投与で、非経口的に、吸入スプレーで、局所に、経直腸で、鼻腔内に、頬側に、膣内に、又は移植貯留層を介して、好ましくは経口又は膣内投与又は注射による投与で、投与される。
本発明の医薬組成物は、従来の非毒性の薬学的に許容される担体、アジュバント又は賦形剤を含有することができる。ある場合には、製剤のｐＨを薬学的に許容される酸、塩基又は緩衝剤を用いて調節して製剤化した化合物又はその送達形態の安定性を増大することができる。
本明細書で用いられる用語「非経口的」は、皮下、皮内、静脈内、筋肉内、関節内、動脈内、滑液嚢内、胸骨内、鞘内、病巣内、及び頭蓋内投与又は点滴方法を包含する。]
[0201] 剤形の例は、これに限定されないが、錠剤；カプレット；ソフトエラスティックゼラチンカプセルのようなカプセル（capsules）；カプセル（cachets）；トローチ；ロゼンジ；分散液；坐剤；軟膏；パップ（湿布）；ペースト；粉末剤；包帯剤；クリーム；硬膏；溶液；パッチ；エアゾール（例えば、経鼻スプレー又は吸入剤）；ゲル；懸濁液（例えば、水性又は非水性液体懸濁液、水中油型乳剤又は油中水型乳剤）、溶液、及びエリキシル剤を含む、経口又は粘膜投与に適している液体剤形；患者への非経口投与に適している液体剤形；及び患者へ非経口投与するのに適している液体剤形を再構築できる無菌の固体（例えば、結晶性又は多形体の固体）を包含する。]
[0202] 医薬組成物を無菌注射製剤（例えば、無菌水性又は油性懸濁液のような）とすることができる。この懸濁液は適切な分散又は湿潤剤（例えば、Ｔｗｅｅｎ（登録商標）８０のような）及び懸濁剤を用いる、当該技術分野で公知の技術に従って製剤化できる。無菌注射用製剤は、非毒性の非経口に許容される希釈剤又は溶媒中の無菌注射用溶液又は懸濁液、例えば１，３−ブタンジオール中の溶液であってもよい。使用できる許容賦形剤及び溶媒の中には、マンニトール、水、リンゲル溶液、及び等張塩化ナトリウム溶液がある。また、無菌の固定油は溶媒又は懸濁媒体として通常用いられている。この目的のために、合成モノ−又はジ−グリセリドを含む、無菌固定油を用いることができる。オレイン酸及びそのグリセリド誘導体のような、脂肪酸は、特にポリオキシエチル化タイプのオリーブ油及びひまし油のような、天然の薬学的に許容される油がそうであるように、注射剤の調製において有用である。これらの油性溶液又は懸濁液は、乳剤又は懸濁液のような薬学的に許容される剤形の製剤化において通常用いられている、長鎖アルコール希釈又は分散剤、又はカルボキシメチルセルロース又は同様の分散剤も含有することができる。
その他の通常用いられている、Ｔｗｅｅｎ、Ｓｐａｎｓ及び／又は同様な乳化剤のような界面活性剤、又は薬学的に許容される固体、液体、又はその他の剤形の製造に通常用いられているバイオアベイラビリティー増強剤も製剤化のために用いられてもよい。]
[0203] 本発明の医薬組成物は、これに限定されないが、カプセル、錠剤、乳剤及び水性の懸濁剤、分散剤並びに溶液をを包含する、経口投与に許容される何れかの剤形で、経口的に投与されてもよい。経口使用のための錠剤の場合、通常用いられる担体は乳糖及びコーンスターチを包含する。ステアリン酸マグネシウムのような滑沢剤も通常添加する。カプセル形態で経口投与するために、有用な希釈剤は、乳糖及び乾燥コーンスターチを包含する。水性懸濁液及び／又は乳剤を経口で投与する場合は、活性成分を油層に懸濁又は溶解して、乳化剤及び／又は懸濁化剤と混合することができる。所望により、甘味剤及び／又は着香剤及び／又は着色剤を添加できる。]
[0204] 本発明の医薬組成物を、直腸内投与のための坐剤の形態で投与することもできる。これらの組成物は、本発明の化合物を、室温では固体であるが直腸内の温度では液体であるので、直腸内で融解して活性化合物を放出する、非刺激性の賦形剤と混合することによって製造することができる。このような物質は、これに限定されないが、ココアバター、蜜蝋及びポリエチレングリコールを包含する。]

权利要求:

請求項1
ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインの安定化αらせんを含有してなる、改変ポリペプチド。
請求項2
当該安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインが、炭化水素架橋で安定化されている、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項3
当該安定化ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインが、２つ又はそれ以上の炭化水素架橋で安定化されている、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項4
当該改変ポリペプチドが２０又はそれ以上のアミノ酸である、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項5
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、式：ａｂｃｄｅｆｇ（式中の、ａ及びｄは疎水性アミノ酸残基であって、当該式は２回又はそれ以上反復している）：を含有してなる、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項6
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、式：−−Ｗ−−Ｗ−−−Ｉ−−Ｙ−−−Ｉ−−Ｌ−−−Ｓ−−Ｑ−−−Ｎ−−Ｅ−−−Ｌ（式中の、「−」は何れのアミノ酸であってもよい）：又はそれらの同類アミノ酸置換を含有してなる、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項7
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、式：−ＴＷ−−ＷＤＲ−Ｉ−−Ｙ−−−Ｉ−−ＬＩ−−−Ｑ−−ＱＥＫ−Ｅ−−Ｌ−ＥＬ（式中の、「−」は何れのアミノ酸であってもよい）：又はそれらの同類アミノ酸置換を含有している、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項8
当該ポリペプチドが式（Ｉ）：（式中の、それぞれのＲ１及びＲ２は独立して、Ｈ又はＣ１〜Ｃ１０アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、又はヘテロシクリルアルキルであり；Ｒ３は、アルキル、アルケニル、アルキニル、［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎであり、これらはそれぞれぞれ０〜６個のＲ５で置換されており；Ｒ４は、アルキル、アルケニル、又はアルキニルであり；Ｒ５は、ハロ、アルキル、ＯＲ６、Ｎ（Ｒ６）２、ＳＲ６、ＳＯＲ６、ＳＯ２Ｒ６、ＣＯ２Ｒ６、Ｒ６、蛍光部分、又は放射性同位元素であり；Ｋは、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、ＣＯＮＲ６、又はであり；Ｒ６は、Ｈ，アルキル、又は治療剤であり；ｎは、１〜４の整数であり；ｘは、２〜１０の整数であり；それぞれのｙは独立して、０〜１００の整数であり、ｚは、１〜１０の整数であり；そしてそれぞれのＸａａは独立して、アミノ酸である）：を含有してなり、改変ポリペプチドはαらせんを形成して、配列番号１〜３、１３、１４、図５、図６、ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又はＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ（式中の、Ｘは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、そしてＢはメチオニン又はノルロイシンである）よりなる群から選ばれるアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一である、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項9
当該炭化水素架橋が、当該ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインの第１アミノ酸及び第２アミノ酸を結合し、そして当該第２アミノ酸が当該第１アミノ酸から下流の３〜１０個のアミノ酸残基である、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項10
当該炭化水素架橋が、ｉ番目とｉ＋３番目のアミノ酸残基を結合するように位置している、請求項２に記載のポリペプチド。
請求項11
当該炭化水素架橋が、ｉ番目とｉ＋４番目のアミノ酸残基を結合するように位置している、請求項２に記載のポリペプチド。
請求項12
当該炭化水素架橋が、ｉ番目とｉ＋７番目のアミノ酸残基を結合するように位置している、請求項２に記載のポリペプチド。
請求項13
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも１０％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項14
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも２０％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項15
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも３５％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項16
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも５０％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項17
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも６０％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項18
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも７０％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項19
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも８０％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項20
当該改変ポリペプチドが、円偏光二色性で測定すると水溶液におけるαらせん性を少なくとも９０％有している、請求項１に記載のポリペプチド。
請求項21
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、ＨＩＶ−１ｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン１である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項22
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、ＨＩＶ−１ｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン２である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項23
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、ＨＩＶ−２ｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン１である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項24
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、ＨＩＶ−２ｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン２である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項25
当該改変ポリペプチドがキメラである、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項26
当該キメラが、ＷＱＥＷＥＱＫＩＴＡＬＬＥＱＡＱＩＱＱＥＫＮＥＹＥＬＱＫＬＤＫＷＡＳＬＷＥＷＦのアミノ酸配列を有している、請求項２５に記載の改変ポリペプチド。
請求項27
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、ＳＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインである、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項28
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、ＲＱＬＩＳＧＩＶＱＱＱＮＮＬＬＲＡＩＥＡＱＱＨＬＬＱＬＴＶＷＧＩＫＱＬＱＡＲＩＬＡＶＥＲＹＬＱＤＱＱＬと３０％又はそれ以上同一のアミノ酸配列を含有している、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項29
当該７アミノ酸繰り返しドメイン２が、αらせんを形成し、そして図５のアミノ酸配列よりなる群から選ばれるアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一である、請求項２２に記載の改変ポリペプチド。
請求項30
当該７アミノ酸繰り返しドメイン２が、αらせんを形成し、そして図６のアミノ酸配列よりなる群から選ばれるアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一である、請求項２２に記載の改変ポリペプチド。
請求項31
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、αらせんを形成し、そしてＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ（配列番号１）のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項32
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、αらせんを形成し、そしてＭＴＷＭＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ（配列番号１３）のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項33
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、αらせんを形成し、そしてＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ（配列番号３）のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項34
当該７アミノ酸繰り返しドメインが、αらせんを形成し、そしてＮＮＬＬＲＡＩＥＡＱＱＨＬＬＱＬＴＶＷＧＩＫＱＬＱＡＲＩＬＡＶＥＲＹＬＱＤＱ（配列番号２）のアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項35
当該７アミノ酸繰り返しドメインが式：ＢＴＷ*ＢＥＷＤ*ＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ（式中の、* は炭化水素架橋によって結合されるアミノ酸残基を特定していて、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである）：を有している、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項36
当該７アミノ酸繰り返しドメインが式：ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱ*ＥＫＮＥ*ＱＷＬＬＥ（式中の、* は炭化水素架橋によって結合されるアミノ酸残基を特定していて、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである）：を有している、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項37
当該改変ポリペプチドが：ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又はＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ（式中の、Ｘは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである）：よりなる群から選ばれる式を有している、請求項２に記載の改変ポリペプチド。
請求項38
安定化ウィルスαらせん７アミノ酸繰り返し−類縁ドメインを含有してなる、改変ポリペプチド。
請求項39
当該安定化ウィルスαらせん７アミノ酸繰り返し−類縁ドメインが、呼吸器合胞体ウィルス由来である、請求項３８に記載の改変ポリペプチド。
請求項40
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＹＴＳＶＩＴＩＥＬＳＮＩＫＥＮＫＣＮＧＴＤＡＫＶＫＬＩＫＱＥＬＤＫＹＫＮＡＶＴＥＬＱＬＬＭＱＳＴ（配列番号４）、ＳＱＩＡＶＳＫＶＬＨＬＥＧＥＶＮＫＩＫＮＡＬＬＳＴＮＫＡＶＶＳＬＳＮＧＶＳＶＬＴＳＫＶＬＤＬＫＳＹＩＮＮＱＬＬＰＩ−（配列番号１１）、及びＰＩＩＮＹＹＤＰＬＶＦＰＳＤＥＦＤＡＳＩＳＱＶＮＥＫＩＮＱＳＬＡＦＩＲＲＳＤＥＬＬＨＮＶＮＴＧＫＳＴＴＮＩＭ（配列番号１２）よりなる群から選ばれるアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有してなる、請求項３９に記載の改変ポリペプチド。
請求項41
当該改変ポリペプチドが、ＦＹＤＰＬＶＦＰＳＤＥＦＤＡＳＩＳＱＶＮＥＫＩＮＱＳＬＡＦＩＲＫＳＤＥＬＬ（配列番号５）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項３９に記載の改変ポリペプチド。
請求項42
当該安定化ウィルスαらせん７アミノ酸繰り返し−類縁ドメインが、パラインフルエンザウィルス由来である、請求項３８に記載の改変ポリペプチド。
請求項43
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＡＬＧＶＡＴＳＡＱＩＴＡＡＶＡＬＶＥＡＫＱＡＲＳＤＩＥＫＬＫＥＡＩＲ（配列番号６）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項４２に記載の改変ポリペプチド。
請求項44
当該安定化ウィルスαらせん７アミノ酸繰り返し−類縁ドメインが、インフルエンザウィルス由来である、請求項３８に記載の改変ポリペプチド。
請求項45
パラミクソウィルス、オルトミクソウィルス、コロナウィルス、インフルエンザ及びフィロウィルスよりなる群から選ばれるウィルス由来の、安定化ウィルスαらせん７アミノ酸繰り返し様ドメインを含有してなる、改変ポリペプチド。
請求項46
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＮＶＬＹＥＮＱＫＱＬＡＮＱＦＮＫＡＩＳＱＩＱＥＳＬＴＴＴＳＴＡＬＧＫＬＱＤＶＶＮＱＮＡＱＡＬＮＴＬＶＫＱＬＳＳＮＦＧＡＩＳＳＶＬＮＤＩＬＳＲＬＤＫＶＥＡＥ（配列番号７）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項４５に記載の改変ポリペプチド。
請求項47
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＴＳＰＤＶＤＦＧＤＩＳＧＩＮＡＳＶＶＮＩＱＫＥＩＤＲＬＮＥＶＡＫＮＬＮＥＳＬＩＤＬＱＥＬＧＫＹ（配列番号８）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項４５に記載の改変ポリペプチド。
請求項48
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＤＧＬＩＣＧＬＲＱＬＡＮＥＴＴＱＡＬＱＬＦＬＲＡＴＴＥＬＲＴＦＳＩＬＮＲＫＡＩＤＦＬＬ（配列番号９）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項４５に記載の改変ポリペプチド。
請求項49
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＤＷＴＫＮＩＴＤＫＩＤＱＩＩＨＤＦＶＤＫＴＬＰＤ（配列番号１０）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項４５に記載の改変ポリペプチド。
請求項50
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＳＧＩＡＶＳＫＶＬＨＬＥＧＥＶＮＫＩＫＮＡＬＬＳＴＮＫＡＶＶＳＬＳＮＧＶＳＶＬＴＳＫＶＬＤＬＫＳＹＩＮＮＱＬＬＰＩ−（配列番号１１）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項４５に記載の改変ポリペプチド。
請求項51
当該改変ポリペプチドが、αらせんを形成し、そしてＰＩＩＮＹＹＤＰＬＶＦＰＳＤＥＦＤＡＳＩＳＱＶＮＥＫＩＮＱＳＬＡＦＩＲＲＳＤＥＬＬＨＮＶＮＴＧＫＳＴＴＮＩＭ（配列番号１２）と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を含有している、請求項４５に記載の改変ポリペプチド。
請求項52
式（Ｉ）：（式中の、それぞれのＲ１及びＲ２は独立して、Ｈ又はＣ１〜Ｃ１０アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、又はヘテロシクリルアルキルであり；Ｒ３は、アルキル、アルケニル、アルキニル、［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎであり、これらはそれぞれ０〜６個のＲ５で置換されていて；Ｒ４は、アルキル、アルケニル、又はアルキニルであり；Ｒ５は、ハロ、アルキル、ＯＲ６、Ｎ（Ｒ６）２、ＳＲ６、ＳＯＲ６、ＳＯ２Ｒ６、ＣＯ２Ｒ６、Ｒ６、蛍光部分、又は放射性同位元素であり；Ｋは、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、ＣＯＮＲ６、又はであり；Ｒ６は、Ｈ、アルキル、又は治療薬剤であり；ｎは、１〜４の整数であり；ｘは、２〜１０の整数であり；それぞれのｙは独立して、０〜１００の整数であり；ｚは、１〜１０の整数であり；そしてそれぞれのＸａａは独立して、アミノ酸である）：の改変ポリペプチドであって、改変ポリペプチドはαらせんを形成し、そして配列番号４〜１２よりなる群から選ばれるアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を有している、改変ポリペプチド。
請求項53
式（ＩＩ）：（式中の、それぞれのＲ１及びＲ２は独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、又はヘテロシクリルアルキルであり；それぞれのｎは独立して、１〜１５の整数であり；ｘは、２、３、又は６であり；それぞれのｙは独立して、０〜１００の整数であり；ｚは、１〜１０の整数であり；それぞれのＸａａは独立して、アミノ酸である）：の改変ポリペプチドであり、そして改変ポリペプチドはαらせんを形成して、配列番号１〜１４、図５、図６、ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又はＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ（式中の、Ｘは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである）よりなる群から選ばれるアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を有している、改変ポリペプチド。
請求項54
式（ＩＩＩ）（式中の、それぞれのＲ１及びＲ２は独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、又はヘテロシクリルアルキルであり；Ｒ３は、アルキル、アルケニル、アルキニル、［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎ又は天然のアミノ酸側鎖であり、これらはそれぞれ０〜６個のＲ５で置換されており；Ｒ４は、アルキル、アルケニル、又はアルキニルであり；Ｒ５は、ハロ、アルキル、ＯＲ６、Ｎ（Ｒ６）２、ＳＲ６、ＳＯＲ６、ＳＯ２Ｒ６、ＣＯ２Ｒ６、Ｒ６、蛍光部分、又は放射性同位元素であり；Ｋは、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、ＣＯＮＲ６、又はであり；Ｒ６は、Ｈ，アルキル、又は治療剤であり；Ｒ７は、アルキル、アルケニル、アルキニル、［Ｒ４−−Ｋ−−Ｒ４］ｎ又は天然のアミノ酸側鎖であって、これらのそれぞれは０〜６個のＲ５で置換されており；ｎは、１〜４の整数であり；ｘは、２〜１０の整数であり；それぞれのｙは独立して、０〜１００の整数であり；ｚは、１〜１０の整数であり；そしてそれぞれのＸａａは独立して、アミノ酸である）：の改変ポリペプチドであり、そして改変ポリペプチドはαらせんを形成して、配列番号１〜１４、図５、図６、ＢＴＷＸＥＷＤＸＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＸＥＩＮＸＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＸＹＴＳＸＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＥＷＤＲＥＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＸＳＬＩＸＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＸＮＥＱＸＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＸＬＬＥＸＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＸＳＬＷＸＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＫＷＡＳＬＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＸＳＱＮＸＱＥＫＮＥＱＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＹＴＳＸＩＨＳＸＩＥＥＳＱＮＱＱＸＫＮＥＸＥＬＬＥＬＤＸＷＡＳＸＷＮＷＦ、ＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＱＸＥＫＮＸＱＥＬＬＥ、又はＢＴＷＢＸＷＤＲＸＩＮＮＹＴＳＬＩＨＳＬＩＥＥＳＱＮＸＱＥＫＸＥＱＥＬＬＥ（式中の、Ｘは何れかのアミノ酸であって、炭化水素架橋によって結合しているアミノ酸残基を更に特定し、Ｂはメチオニン又はノルロイシンである）よりなる群から選ばれるアミノ酸配列と３０％又はそれ以上同一であるアミノ酸配列を有している、改変ポリペプチド。
請求項55
ＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインの安定化αらせんを含有してなる、組成物。
請求項56
パラミクソウィルス、オルトミクソウィルス、コロナウィルス、インフルエンザ及びフィロウィルスよりなる群から選ばれるウィルス由来の安定化αらせん７アミノ酸繰り返し−類縁ドメインを含有してなる、組成物。
請求項57
請求項１〜５４の何れか一項に記載の改変ポリペプチドを含有してなる、組成物。
請求項58
当該組成物が医薬組成物である、請求項５５〜５７の何れか一項に記載の組成物。
請求項59
安定化αらせんＨＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメインを有する組成物及び使用説明書を含有してなる、キット。
請求項60
パラミクソウィルス、オルトミクソウィルス、コロナウィルス、インフルエンザ及びフィロウィルスよりなる群から選ばれるウィルス由来の安定化ウィルスαらせん７アミノ酸繰り返し類縁ドメインを有する組成物及び使用説明書を含有してなる、キット。
請求項61
請求項５５〜５７の何れか一項に記載の組成物及び使用説明書を含有してなる、キット。
請求項62
細胞の存在下でウィルスを請求項１〜３７の何れか一項に記載の改変ポリペプチドの有効用量と接触させて、それによってウィルスによる細胞の感染を阻害することを含有してなる、ＨＩＶの細胞への伝播を阻害する方法。
請求項63
当該改変ポリペプチドが医薬組成物中にある、請求項６２に記載の方法。
請求項64
細胞の存在下でウィルスを請求項３８〜４１及び５２〜５４の何れか一項に記載の改変ポリペプチドの有効用量と接触させて、それによってウィルスによる細胞の感染を阻害することを含有してなる、ＲＳＶの細胞への伝播を阻害する方法。
請求項65
当該改変ポリペプチドが医薬組成物中にある、請求項６４に記載の方法。
請求項66
細胞の存在下でウィルスを請求項４２、４３、又は５２〜５４の何れか一項に記載の改変ポリペプチドの有効用量と接触させて、それによってウィルスによる細胞の感染を阻害することを含有してなる、パラインフルエンザウィルスの細胞への伝播を阻害する方法。
請求項67
細胞の存在下でウィルスを請求項４４に記載の改変ポリペプチドの有効用量と接触させて、それによってウィルスによる細胞の感染を阻害することを含有してなる、インフルエンザウィルスの細胞への伝播を阻害する方法。
請求項68
当該改変ポリペプチドが医薬組成物中にある、請求項６６又は６７に記載の方法。
請求項69
細胞の存在下でウィルスを請求項５６に記載の組成物の有効用量と接触させることを含有してなる、パラミクソウィルス、オルトミクソウィルス、コロナウィルス、インフルエンザ又はフィロウィルスの細胞への伝播を阻害する方法。
請求項70
当該組成物が医薬組成物である、請求項６９に記載の方法。
請求項71
請求項１〜３７の何れか一項に記載の改変ポリペプチドを含有している医薬組成物の有効用量を個体に投与することを含有してなる、ＨＩＶに感染している個体におけるＡＩＤＳを治療するか又は発症を遅らせる方法。
請求項72
請求項１〜３７の何れか一項に記載の改変ポリペプチドを含有している医薬組成物の有効用量を個体に投与することを含有してなる、ＨＩＶを有する個体におけるＣＤ４細胞の数を増大する方法。
請求項73
感染した細胞を請求項１〜３７の何れか一項に記載の改変ポリペプチドを含有している組成物の有効用量と接触させることを含有してなる、ＨＩＶ感染細胞とＨＩＶ−１に感染していない細胞の間の合胞体形成を阻害する方法。
請求項74
ウィルスを請求項１〜３７の何れか一項に記載の改変ポリペプチドの有効用量と接触させて、それによってＨＩＶを非感染性にすることを含有してなる、ＨＩＶを不活性化する方法。
請求項75
請求項１〜３７の何れか一項に記載の改変ポリペプチドを含有している医薬組成物の有効用量を個体に投与することを含有してなる、個体におけるＨＩＶ感染を予防する方法。
請求項76
請求項１〜３７又は５２〜５４の何れか一項に記載の改変ポリペプチドを対象に投与することを含有してなる、抗体を生成する方法。
請求項77
請求項１〜３７又は５２〜５４の何れか一項に記載の改変ポリペプチドに対して生成した抗体の有効用量を投与することによる、個体におけるＨＩＶ感染を予防又は治療する方法。
請求項78
当該７アミノ酸繰り返しドメインがＳＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン１である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項79
当該７アミノ酸繰り返しドメインがＳＩＶｇｐ４１の７アミノ酸繰り返しドメイン２である、請求項１に記載の改変ポリペプチド。
請求項80
請求項１〜３７又は５２〜５４の何れか一項に記載の改変ポリペプチドに対する抗体。
請求項81
当該改変ポリペプチドを子宮頸部又は膣内に投与する、請求項７４又は７５に記載の方法。
請求項82
当該改変ポリペプチドをゲル又は子宮頸部リング製剤で投与する、請求項８１に記載の方法。
請求項83
ポリペプチドを経腸的に投与する、請求項６２〜７５の何れか一項に記載の方法。
請求項84
ポリペプチドを経口投与する、請求項８３に記載の方法。
請求項85
ポリペプチドを非経口投与する、請求項６２〜７５の何れか一項に記載の方法。